More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3698 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3698  glutamine ABC transporter permease protein  100 
 
 
218 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1155  glutamine ABC transporter permease protein  84.86 
 
 
218 aa  374  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1707  glutamine ABC transporter permease protein  77.42 
 
 
228 aa  329  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.165583  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3440  glutamine ABC transporter permease protein  66.06 
 
 
218 aa  287  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1960  glutamine ABC transporter permease protein  66.51 
 
 
218 aa  286  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120832  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4283  glutamine ABC transporter permease protein  65.9 
 
 
235 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4083  glutamine ABC transporter permease protein  65.9 
 
 
235 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292626  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2097  glutamine ABC transporter permease protein  66.06 
 
 
218 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0754215  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1486  glutamine ABC transporter permease protein  66.06 
 
 
218 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2390  glutamine ABC transporter permease protein  65.9 
 
 
235 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3271  glutamine ABC transporter permease protein  65.9 
 
 
235 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1405  glutamine ABC transporter permease protein  65.9 
 
 
235 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1125  glutamine ABC transporter permease protein  65.9 
 
 
235 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3157  glutamine ABC transporter permease protein  65.9 
 
 
235 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0481708  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2356  glutamine ABC transporter permease protein  64.52 
 
 
230 aa  278  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00777  glutamine ABC transporter permease protein  58.45 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2832  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.45 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0879  glutamine ABC transporter permease protein  58.45 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00794  hypothetical protein  58.45 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2833  glutamine ABC transporter permease protein  58.45 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.2982  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0834  glutamine ABC transporter permease protein  58.45 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000546906  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0866  glutamine ABC transporter permease protein  58.45 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178122  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0959  glutamine ABC transporter permease protein  58.45 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000482918  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2538  glutamine ABC transporter permease protein  57.99 
 
 
219 aa  265  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998158  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2879  glutamine ABC transporter permease protein  57.53 
 
 
219 aa  262  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618158  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0977  glutamine ABC transporter permease protein  57.99 
 
 
219 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.034777  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0893  glutamine ABC transporter permease protein  57.99 
 
 
219 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110521  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0865  glutamine ABC transporter permease protein  57.99 
 
 
219 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.813603  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0956  glutamine ABC transporter permease protein  57.99 
 
 
219 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0688555  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0924  glutamine ABC transporter permease protein  57.99 
 
 
219 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0141353  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1297  glutamine ABC transporter permease protein  58.45 
 
 
219 aa  258  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0712519  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1599  glutamine ABC transporter permease protein  60.55 
 
 
218 aa  251  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1494  glutamine ABC transporter permease protein  60.55 
 
 
218 aa  251  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0612957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1774  glutamine ABC transporter permease protein  60.55 
 
 
218 aa  251  7e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000313733  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1478  glutamine ABC transporter permease protein  58.45 
 
 
219 aa  244  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1583  glutamine ABC transporter permease protein  57.53 
 
 
219 aa  242  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2489  glutamine ABC transporter permease protein  58.45 
 
 
219 aa  239  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  52.09 
 
 
251 aa  223  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2392  glutamine ABC transporter permease protein  54.09 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303951  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.11 
 
 
227 aa  219  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.63 
 
 
223 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.09 
 
 
223 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2140  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.75 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0354411 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2368  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.6 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3046  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.5 
 
 
237 aa  181  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156389  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3297  amino acid ABC transporter permease  46.48 
 
 
223 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  41.59 
 
 
216 aa  171  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.12 
 
 
216 aa  169  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
492 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
493 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  44.66 
 
 
501 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.74 
 
 
235 aa  157  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 
221 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0162  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.33 
 
 
222 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  38.71 
 
 
222 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 
233 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  39.34 
 
 
223 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0415  putative amino acid ABC transporter, permease protein  36.32 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2587  amino acid ABC transporter permease  38.97 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4903  putative amino acid ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1870  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.93 
 
 
239 aa  145  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0338  amino acid ABC transport system, permease  37.26 
 
 
269 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0145734  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  37.74 
 
 
216 aa  145  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  36.4 
 
 
237 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.21 
 
 
216 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.21 
 
 
216 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.74 
 
 
216 aa  142  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4670  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.68 
 
 
226 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5480  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 
219 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.72 
 
 
221 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.31 
 
 
315 aa  141  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538203  normal  0.259206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0352  amino acid ABC transproter, permease  36.79 
 
 
291 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5743  putative amino acid ABC transporter permease  36.79 
 
 
269 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38 
 
 
503 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3743  amino acid ABC transporter permease  36.74 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.870157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1595  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.68 
 
 
271 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.500436  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0835  amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.86 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.53 
 
 
513 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3092  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  39.62 
 
 
219 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3004  polar amino acid ABC transporter permease  39.62 
 
 
219 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3091  amino acid ABC transporter permease  39.46 
 
 
220 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.832424  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  32.11 
 
 
727 aa  137  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2135  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  39.62 
 
 
219 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2610  polar amino acid ABC transporter permease  39.62 
 
 
219 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2004  polar amino acid ABC transporter permease  39.62 
 
 
219 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.695709  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1548  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  38.68 
 
 
219 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0776  polar amino acid ABC transporter permease  39.62 
 
 
219 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3057  polar amino acid ABC transporter permease  39.62 
 
 
219 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4076  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.28 
 
 
218 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.8 
 
 
218 aa  136  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2776  amino acid ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.636718  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1941  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.14 
 
 
220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00173617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2504  amino acid ABC transporter permease  37.16 
 
 
220 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12542  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1061  amino acid ABC transporter permease  39.9 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.958726  normal  0.719789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.51 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0742  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.21 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00358  amino acid ABC transporter transmembrane protein  37.62 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1655  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.02 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0134455  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0904  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.32 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  34.1 
 
 
502 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>