More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2392 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2392  glutamine ABC transporter permease protein  100 
 
 
219 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303951  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2879  glutamine ABC transporter permease protein  80.82 
 
 
219 aa  358  4e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1297  glutamine ABC transporter permease protein  76.71 
 
 
219 aa  349  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0712519  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0893  glutamine ABC transporter permease protein  76.71 
 
 
219 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110521  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0956  glutamine ABC transporter permease protein  76.71 
 
 
219 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0688555  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0865  glutamine ABC transporter permease protein  76.71 
 
 
219 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.813603  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0924  glutamine ABC transporter permease protein  76.71 
 
 
219 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0141353  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0977  glutamine ABC transporter permease protein  76.71 
 
 
219 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.034777  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2489  glutamine ABC transporter permease protein  84.93 
 
 
219 aa  341  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00777  glutamine ABC transporter permease protein  74.89 
 
 
219 aa  339  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2832  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  74.89 
 
 
219 aa  339  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0834  glutamine ABC transporter permease protein  74.89 
 
 
219 aa  339  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000546906  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0879  glutamine ABC transporter permease protein  74.89 
 
 
219 aa  339  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0959  glutamine ABC transporter permease protein  74.89 
 
 
219 aa  339  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000482918  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2833  glutamine ABC transporter permease protein  74.89 
 
 
219 aa  339  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.2982  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0866  glutamine ABC transporter permease protein  74.89 
 
 
219 aa  339  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178122  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00794  hypothetical protein  74.89 
 
 
219 aa  339  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2538  glutamine ABC transporter permease protein  74.43 
 
 
219 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998158  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1583  glutamine ABC transporter permease protein  82.19 
 
 
219 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1478  glutamine ABC transporter permease protein  75.8 
 
 
219 aa  326  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1494  glutamine ABC transporter permease protein  75.8 
 
 
218 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0612957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1599  glutamine ABC transporter permease protein  75.8 
 
 
218 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1774  glutamine ABC transporter permease protein  75.8 
 
 
218 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000313733  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1960  glutamine ABC transporter permease protein  56.16 
 
 
218 aa  258  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120832  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3440  glutamine ABC transporter permease protein  55.71 
 
 
218 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2097  glutamine ABC transporter permease protein  55.25 
 
 
218 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0754215  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1486  glutamine ABC transporter permease protein  55.25 
 
 
218 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4283  glutamine ABC transporter permease protein  55.5 
 
 
235 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4083  glutamine ABC transporter permease protein  55.5 
 
 
235 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292626  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2390  glutamine ABC transporter permease protein  55.05 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3271  glutamine ABC transporter permease protein  55.05 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1125  glutamine ABC transporter permease protein  55.05 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1405  glutamine ABC transporter permease protein  55.05 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3157  glutamine ABC transporter permease protein  55.05 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0481708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1155  glutamine ABC transporter permease protein  55.71 
 
 
218 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2356  glutamine ABC transporter permease protein  54.79 
 
 
230 aa  250  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1707  glutamine ABC transporter permease protein  55.25 
 
 
228 aa  246  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.165583  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3698  glutamine ABC transporter permease protein  54.09 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.77 
 
 
227 aa  224  6e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53 
 
 
223 aa  223  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  51.15 
 
 
251 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2368  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.44 
 
 
226 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.77 
 
 
223 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3046  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.99 
 
 
237 aa  191  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156389  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3297  amino acid ABC transporter permease  51.63 
 
 
223 aa  188  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2140  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.49 
 
 
218 aa  182  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0354411 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.74 
 
 
235 aa  164  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.85 
 
 
493 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  43.52 
 
 
216 aa  161  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2234  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.74 
 
 
255 aa  158  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.79 
 
 
218 aa  158  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.52 
 
 
216 aa  158  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  37.5 
 
 
237 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 
216 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  42.72 
 
 
501 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3743  amino acid ABC transporter permease  38.71 
 
 
217 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.870157  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.35 
 
 
216 aa  156  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.57 
 
 
233 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.85 
 
 
219 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.29 
 
 
216 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2509  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.31 
 
 
219 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  38.5 
 
 
216 aa  153  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3563  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1941  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.1 
 
 
220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00173617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 
492 aa  151  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.49 
 
 
221 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2513  amino acid ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 
274 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.98 
 
 
337 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1255  amino acid ABC transporter, permease protein  42.92 
 
 
219 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1738  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  42.92 
 
 
219 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.094824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0766  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  42.92 
 
 
219 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0399907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1823  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  42.92 
 
 
219 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1807  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  42.92 
 
 
219 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1976  amino acid ABC transporter, permease protein  42.92 
 
 
230 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0835  amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.82 
 
 
219 aa  148  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932034 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0396  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  42.92 
 
 
230 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
513 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0214  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  36.94 
 
 
516 aa  148  7e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.002492  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  38.05 
 
 
223 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3092  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  39.3 
 
 
219 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3004  polar amino acid ABC transporter permease  39.3 
 
 
219 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1819  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
334 aa  147  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3057  polar amino acid ABC transporter permease  39.3 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2135  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  39.3 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2610  polar amino acid ABC transporter permease  39.3 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0776  polar amino acid ABC transporter permease  39.3 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2004  polar amino acid ABC transporter permease  39.3 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.695709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1595  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.61 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.500436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.74 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4903  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.44 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3464  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter permease protein EhuC  36.89 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.14 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0904  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  37.32 
 
 
727 aa  145  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0415  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.44 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5480  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.94 
 
 
219 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1655  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.78 
 
 
213 aa  145  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0134455  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0136  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein/permease protein  37.16 
 
 
516 aa  145  6e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000337877  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1548  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  38.81 
 
 
219 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  35.27 
 
 
222 aa  144  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>