More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4312 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  68.45 
 
 
661 aa  642    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4448  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  94.42 
 
 
589 aa  1032    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4312  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
591 aa  1122    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4467  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  94.25 
 
 
589 aa  984    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0773722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2564  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
559 aa  253  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382353  hitchhiker  0.0000221302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.46 
 
 
819 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 
855 aa  161  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
819 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
620 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.36 
 
 
679 aa  157  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
850 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
850 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 
848 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3045  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 
954 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 
804 aa  151  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42670  Sensory histidine protein kinase CbrA  32.15 
 
 
981 aa  150  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416099  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  29.71 
 
 
1092 aa  150  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
1432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.46 
 
 
1081 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
991 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000969954 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
673 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
987 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  29.34 
 
 
737 aa  147  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0835  histidine kinase  31.45 
 
 
418 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.882013  normal  0.0872609 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
991 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.0000734254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
991 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000340339 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
551 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
611 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
611 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5744  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 
510 aa  144  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
495 aa  144  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
785 aa  143  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  37.21 
 
 
611 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.09 
 
 
1021 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 
801 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
991 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
926 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
985 aa  143  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
408 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
570 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
970 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  30.91 
 
 
983 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  30.91 
 
 
983 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
1021 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.94 
 
 
1132 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
662 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  28.46 
 
 
608 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
647 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
642 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  28.46 
 
 
608 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.47 
 
 
1255 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 
862 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.46 
 
 
608 aa  139  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  28.46 
 
 
608 aa  139  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  28.46 
 
 
608 aa  139  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 
1215 aa  139  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
680 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 
1122 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  33.55 
 
 
410 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  32.41 
 
 
975 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1222 aa  138  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  33.65 
 
 
936 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
523 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
523 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  30.29 
 
 
982 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 
1465 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
753 aa  137  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
591 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
645 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4780  histidine kinase  28.57 
 
 
742 aa  136  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
520 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3002  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
1234 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
637 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  28.2 
 
 
608 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  35.55 
 
 
310 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0089  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
705 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0206322  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 
712 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 
759 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 
935 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
516 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
468 aa  135  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.634058  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1746  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  25.83 
 
 
506 aa  135  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  28.61 
 
 
614 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
557 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 
871 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.63 
 
 
1215 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  30.7 
 
 
986 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
1194 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
589 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1250  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  27.07 
 
 
506 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.112207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  30.74 
 
 
516 aa  134  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  29.61 
 
 
749 aa  134  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  28.53 
 
 
754 aa  134  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  33.33 
 
 
887 aa  134  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
654 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  37.77 
 
 
655 aa  134  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 
752 aa  133  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 
1247 aa  134  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
729 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>