More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4780 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4780  histidine kinase  100 
 
 		 742 aa  1514    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4673  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.47 
 
 		 713 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 408 aa  179  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 408 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.397309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.84 
 
 		 926 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 		 970 aa  163  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1768  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 576 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  37.11 
 
 		 313 aa  160  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  24.83 
 
 		 936 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.99 
 
 		 926 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  30.33 
 
 		 410 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.81 
 
 		 933 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2233  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.23 
 
 		 747 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 588 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 801 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 577 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1360  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 403 aa  153  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 862 aa  153  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0835  histidine kinase  29.97 
 
 		 418 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.882013  normal  0.0872609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  33.09 
 
 		 982 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  36.61 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  30.68 
 
 		 975 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 557 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 819 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.4 
 
 		 819 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  38.25 
 
 		 591 aa  151  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0595  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 680 aa  151  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 991 aa  151  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000340339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 691 aa  150  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 857 aa  150  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 991 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.0000734254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 991 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 752 aa  150  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0965  sensor histidine kinase  31.96 
 
 		 982 aa  150  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0832  PAS  32.99 
 
 		 984 aa  150  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253594 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 840 aa  150  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  34.75 
 
 		 852 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 991 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000969954 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 852 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1990  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 677 aa  149  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.871736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 819 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  33.09 
 
 		 983 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 402 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  35.11 
 
 		 853 aa  147  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  33.09 
 
 		 983 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1644  histidine kinase  34.01 
 
 		 779 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000228151 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2729  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 702 aa  147  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.346218 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  28.79 
 
 		 1092 aa  147  9e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 849 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 671 aa  146  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.47 
 
 		 952 aa  146  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 804 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 552 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0813  histidine kinase  33.59 
 
 		 587 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  29.79 
 
 		 866 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 619 aa  145  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 552 aa  144  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 753 aa  144  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3588  two-component sensor kinase CbrA  31.62 
 
 		 984 aa  144  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.883039 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  33.98 
 
 		 567 aa  144  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 711 aa  144  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.598881  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2828  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 584 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42670  Sensory histidine protein kinase CbrA  33.09 
 
 		 981 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 645 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 559 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 661 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  29.04 
 
 		 556 aa  142  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  36 
 
 		 912 aa  142  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2268  histidine kinase  32.92 
 
 		 571 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  36.55 
 
 		 592 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2844  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 550 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.17 
 
 		 1255 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 592 aa  140  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 655 aa  140  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 985 aa  140  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2043  histidine kinase  32.17 
 
 		 560 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 		 906 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  28.33 
 
 		 1015 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  33.19 
 
 		 587 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  35.58 
 
 		 945 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 		 639 aa  140  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 874 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  30.56 
 
 		 872 aa  140  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 753 aa  140  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  35.84 
 
 		 647 aa  140  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4448  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 589 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 557 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 		 903 aa  139  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 855 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 850 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 551 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0586  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.53 
 
 		 913 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4423  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 678 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0119  sensor histidine kinase with PAS/PAC  28.22 
 
 		 909 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  33.84 
 
 		 903 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 565 aa  138  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 637 aa  138  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 754 aa  138  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 871 aa  138  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>