More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0074 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0074  hypothetical protein  100 
 
 
1037 aa  2149    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.369205  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2324  hypothetical protein  63.04 
 
 
504 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2466  hypothetical protein  62.38 
 
 
504 aa  376  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  38.82 
 
 
675 aa  119  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  36.36 
 
 
555 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  27.54 
 
 
357 aa  107  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  36.02 
 
 
395 aa  102  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  33.51 
 
 
391 aa  99.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  35.22 
 
 
365 aa  99  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  32.13 
 
 
502 aa  94.4  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  34.13 
 
 
792 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  27.66 
 
 
491 aa  81.6  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  34.03 
 
 
785 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  29.5 
 
 
796 aa  78.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  29.5 
 
 
796 aa  78.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  29.1 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  29.69 
 
 
483 aa  73.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  25.36 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.84 
 
 
1055 aa  71.6  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3510  beta-lactamase  28.11 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.189437  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  30.65 
 
 
610 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  28.3 
 
 
478 aa  70.1  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.72 
 
 
595 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  30.65 
 
 
790 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  27.75 
 
 
446 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  30.92 
 
 
496 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0089  beta-lactamase  29.77 
 
 
401 aa  70.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  30.22 
 
 
600 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  26.87 
 
 
513 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  29.26 
 
 
494 aa  69.7  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  25.56 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3756  beta-lactamase  24.88 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  30.41 
 
 
530 aa  68.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  31.74 
 
 
459 aa  68.2  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  35.19 
 
 
485 aa  68.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  27.62 
 
 
505 aa  67.4  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2901  beta-lactamase  24.74 
 
 
760 aa  67.4  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1599  beta-lactamase  27.32 
 
 
382 aa  67  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  26.61 
 
 
399 aa  66.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  27.05 
 
 
429 aa  66.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3549  beta-lactamase  24.26 
 
 
400 aa  65.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  21.86 
 
 
511 aa  65.9  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  25.24 
 
 
395 aa  65.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  30.17 
 
 
834 aa  65.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  27.04 
 
 
450 aa  65.1  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  25.81 
 
 
524 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  24.77 
 
 
590 aa  64.7  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  24.59 
 
 
364 aa  64.7  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.79 
 
 
484 aa  64.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  24.06 
 
 
601 aa  64.3  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.42 
 
 
464 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  28.31 
 
 
423 aa  63.9  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.67 
 
 
508 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  27.03 
 
 
507 aa  63.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  24.32 
 
 
711 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  27.36 
 
 
513 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.04 
 
 
551 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  21.74 
 
 
496 aa  63.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  28.65 
 
 
514 aa  63.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3905  beta-lactamase  27.27 
 
 
397 aa  62.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  28.32 
 
 
364 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  27.37 
 
 
379 aa  62.4  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  28.1 
 
 
531 aa  62  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  26.27 
 
 
793 aa  62  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  27.08 
 
 
580 aa  62  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  24.62 
 
 
351 aa  61.6  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1013  beta-lactamase  24.44 
 
 
367 aa  61.6  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  26.51 
 
 
330 aa  61.6  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  26.77 
 
 
513 aa  61.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  26.78 
 
 
395 aa  61.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  28.05 
 
 
966 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.99 
 
 
487 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3473  beta-lactamase  27.17 
 
 
392 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  23.35 
 
 
395 aa  60.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.23 
 
 
480 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  29.24 
 
 
566 aa  61.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  28.27 
 
 
455 aa  60.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  29.22 
 
 
471 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.6 
 
 
342 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  28.76 
 
 
528 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  27.89 
 
 
370 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  31.29 
 
 
784 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  28.76 
 
 
528 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  26.78 
 
 
498 aa  60.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  26.7 
 
 
461 aa  59.7  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  26.18 
 
 
485 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  27.47 
 
 
447 aa  59.7  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  34.29 
 
 
691 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  34.29 
 
 
691 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  24.51 
 
 
614 aa  59.7  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  26.82 
 
 
497 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  22.8 
 
 
395 aa  59.3  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  26.52 
 
 
325 aa  59.3  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  23.35 
 
 
529 aa  59.3  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  28.26 
 
 
457 aa  59.3  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  24.16 
 
 
530 aa  58.9  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  28.21 
 
 
375 aa  58.9  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  24.26 
 
 
389 aa  58.9  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  23.81 
 
 
588 aa  58.5  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  23.62 
 
 
345 aa  58.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>