55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2466 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2466  hypothetical protein  100 
 
 
504 aa  1053    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2324  hypothetical protein  94.23 
 
 
504 aa  961    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0074  hypothetical protein  62.38 
 
 
1037 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.369205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  29.18 
 
 
365 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  25.84 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  27.45 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  26.52 
 
 
555 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  29.59 
 
 
675 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  31.93 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  23.17 
 
 
588 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  30.64 
 
 
966 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  31.82 
 
 
502 aa  57  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1599  beta-lactamase  25.55 
 
 
382 aa  55.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  22.76 
 
 
484 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  23.8 
 
 
483 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  22.19 
 
 
456 aa  52  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  21.58 
 
 
530 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  25.28 
 
 
446 aa  50.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  24.71 
 
 
445 aa  50.4  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1629  hypothetical protein  29.91 
 
 
318 aa  49.7  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000178179  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2556  beta-lactamase  27.74 
 
 
328 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3510  beta-lactamase  25.93 
 
 
380 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.189437  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  24.74 
 
 
410 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  20.62 
 
 
601 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  20.44 
 
 
715 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  32.39 
 
 
793 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6294  beta-lactamase  23.16 
 
 
394 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  23.86 
 
 
494 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  24.66 
 
 
347 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  28.57 
 
 
528 aa  47  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  28.57 
 
 
528 aa  47  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  24.56 
 
 
790 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  27.32 
 
 
580 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  22.13 
 
 
363 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  22.75 
 
 
513 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  38.46 
 
 
386 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0095  beta-lactamase  26.29 
 
 
270 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  27.19 
 
 
496 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  29.73 
 
 
531 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  25.77 
 
 
677 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  21.69 
 
 
511 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  25.3 
 
 
507 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1189  beta-lactamase  23.64 
 
 
279 aa  44.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.14808  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  21.23 
 
 
395 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  25 
 
 
366 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  23.84 
 
 
430 aa  44.3  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.41 
 
 
371 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  35.71 
 
 
537 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  25.86 
 
 
582 aa  43.9  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.87 
 
 
493 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  24.62 
 
 
543 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2357  beta-lactamase  37.5 
 
 
368 aa  43.5  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  22.8 
 
 
543 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  22.8 
 
 
543 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  28.99 
 
 
491 aa  43.5  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>