More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6294 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6294  beta-lactamase  100 
 
 		 394 aa  801    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5620  beta-lactamase  35.26 
 
 		 417 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141617  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6028  beta-lactamase  34.55 
 
 		 438 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4797  beta-lactamase  32.65 
 
 		 440 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2213  beta-lactamase  28.78 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  30.42 
 
 		 862 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5564  beta-lactamase  30.86 
 
 		 693 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  31.02 
 
 		 933 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.23 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  31.1 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.2 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  35.95 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  28.44 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  28.92 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.83 
 
 		 669 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.95 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  33.13 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  34.97 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  26.21 
 
 		 466 aa  72.8  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  30.46 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  24.65 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  30.19 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  28.68 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  31.15 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  30.77 
 
 		 611 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  31.25 
 
 		 691 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  30.77 
 
 		 593 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.05 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  34.34 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.28 
 
 		 578 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  29.52 
 
 		 691 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  24.25 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  26.09 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  27.98 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  31.87 
 
 		 694 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  31.58 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25.11 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  26.98 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  27.42 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.42 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.42 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  29.44 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  32.03 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  24.52 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  31.06 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  24.52 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  31.68 
 
 		 694 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  30.72 
 
 		 691 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.51 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  27.92 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  28.16 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.58 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  27.27 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  28.92 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  26.78 
 
 		 677 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  28.92 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  28.92 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  27.98 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  27.15 
 
 		 1055 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  32.68 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.77 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  31.79 
 
 		 740 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  30.62 
 
 		 496 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  30.77 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  29.59 
 
 		 364 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  29.74 
 
 		 657 aa  67  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  32.73 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  32.73 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  32.73 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  28.99 
 
 		 633 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.37 
 
 		 601 aa  67  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  31.6 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.83 
 
 		 582 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0888  beta-lactamase  31.48 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0244137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  27.32 
 
 		 507 aa  66.2  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  26.01 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2357  beta-lactamase  26.11 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  24.34 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.06 
 
 		 681 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  24.42 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  30.28 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  25.97 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  25.6 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  25.88 
 
 		 574 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  31.43 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  29.56 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  22.89 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  29.51 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.39 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  24.26 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  30.46 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  29.14 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.08 
 
 		 559 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0059  beta-lactamase  24.81 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  28.32 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  28.33 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.81 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  22.89 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  27.6 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.47 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>