More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5564 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5564  beta-lactamase  100 
 
 		 693 aa  1430    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4797  beta-lactamase  32.45 
 
 		 440 aa  145  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6028  beta-lactamase  29.41 
 
 		 438 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5620  beta-lactamase  29.83 
 
 		 417 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141617  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2213  beta-lactamase  30.18 
 
 		 380 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0920  beta-lactamase  30.38 
 
 		 275 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6294  beta-lactamase  30.86 
 
 		 394 aa  92.8  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  27.09 
 
 		 862 aa  85.5  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  31.98 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  31.75 
 
 		 559 aa  77.8  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.1 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  31.12 
 
 		 453 aa  77  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  28.9 
 
 		 466 aa  76.6  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  24.92 
 
 		 933 aa  74.3  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  28.7 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.35 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  27.56 
 
 		 635 aa  74.3  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  29.15 
 
 		 537 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  30.93 
 
 		 578 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  27.15 
 
 		 410 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  27.49 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  31.8 
 
 		 514 aa  72  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  31.58 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  33.6 
 
 		 658 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  27.3 
 
 		 410 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  31.12 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  28.5 
 
 		 539 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  26.76 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  31.07 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  31.07 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  27.3 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3823  beta-lactamase  24.94 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  27.64 
 
 		 711 aa  67.8  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  34.75 
 
 		 525 aa  68.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  28.64 
 
 		 600 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  29.49 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  23.99 
 
 		 657 aa  67.4  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  27.72 
 
 		 614 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  29.06 
 
 		 480 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  30.35 
 
 		 580 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.64 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  28.71 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  31.72 
 
 		 670 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.44 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  27.33 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.1 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  29.41 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  26.2 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.64 
 
 		 481 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.64 
 
 		 481 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  30.1 
 
 		 483 aa  63.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2105  beta-lactamase  21.25 
 
 		 347 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  25.27 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  26.2 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.56 
 
 		 601 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1013  beta-lactamase  27.59 
 
 		 367 aa  63.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  25.31 
 
 		 533 aa  62.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  25.81 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  25.83 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  35.04 
 
 		 633 aa  61.6  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  29.61 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  25.83 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  26.05 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.44 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  27.91 
 
 		 1055 aa  61.6  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  20.53 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  28.03 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  27.78 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.87 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.87 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25.66 
 
 		 508 aa  60.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  28.65 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  21.98 
 
 		 384 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.78 
 
 		 362 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  22.43 
 
 		 431 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.7 
 
 		 488 aa  60.1  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.89 
 
 		 477 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  25.79 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  30.82 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  23.38 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  27.12 
 
 		 611 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  29.03 
 
 		 513 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.51 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  27.37 
 
 		 519 aa  59.7  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  29.09 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  27.18 
 
 		 507 aa  59.7  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  25.79 
 
 		 675 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  29.5 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  31.13 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.9 
 
 		 681 aa  58.9  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3047  beta-lactamase  26.67 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  25.49 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  24.32 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  26.56 
 
 		 610 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  29.57 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  27.59 
 
 		 720 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  41.33 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  24.81 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3061  beta-lactamase  29.71 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.502148  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  29.27 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>