More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0848 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  50.49 
 
 		 1024 aa  1005    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  100 
 
 		 1028 aa  2078    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  47.63 
 
 		 1019 aa  969    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  50.25 
 
 		 1028 aa  1003    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  45.7 
 
 		 1041 aa  893    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.03 
 
 		 1013 aa  790    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  50.35 
 
 		 1036 aa  1028    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  47.73 
 
 		 1019 aa  969    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  50.25 
 
 		 1029 aa  1008    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  50.44 
 
 		 1028 aa  1020    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  49.55 
 
 		 1025 aa  1024    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  50.64 
 
 		 1025 aa  1017    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  50.05 
 
 		 1021 aa  1021    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  99.9 
 
 		 1028 aa  2075    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  50.65 
 
 		 1036 aa  1030    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  44.43 
 
 		 1016 aa  856    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  40.85 
 
 		 1016 aa  780    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  47.04 
 
 		 1010 aa  921    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  41.59 
 
 		 1019 aa  793    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  47.08 
 
 		 1025 aa  944    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  50.15 
 
 		 1029 aa  1001    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  40.63 
 
 		 1056 aa  798    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  51.07 
 
 		 1027 aa  1003    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  45.85 
 
 		 1023 aa  937    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  38.44 
 
 		 1012 aa  677    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  42.35 
 
 		 1016 aa  778    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  41.62 
 
 		 1013 aa  771    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  46.75 
 
 		 1024 aa  933    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  40.48 
 
 		 1040 aa  792    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  50.75 
 
 		 1032 aa  1023    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  50.83 
 
 		 1029 aa  1003    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  50.83 
 
 		 1029 aa  1003    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  41.14 
 
 		 1017 aa  733    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  38.71 
 
 		 1013 aa  691    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  50.15 
 
 		 1029 aa  1006    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  99.9 
 
 		 1028 aa  2075    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  49.95 
 
 		 1021 aa  1001    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  47.19 
 
 		 1029 aa  927    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  43.92 
 
 		 1014 aa  805    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  42.45 
 
 		 1043 aa  783    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  43.94 
 
 		 1017 aa  773    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  50.63 
 
 		 1027 aa  1004    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  42.79 
 
 		 1009 aa  823    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  42.65 
 
 		 1015 aa  863    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  48.57 
 
 		 1028 aa  1011    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  40.22 
 
 		 1014 aa  717    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  63.17 
 
 		 1020 aa  1314    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  50.15 
 
 		 1029 aa  1002    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  35.14 
 
 		 1027 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  36.03 
 
 		 1035 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  35.93 
 
 		 1035 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  35.27 
 
 		 1020 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  36.13 
 
 		 1035 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.85 
 
 		 1019 aa  572  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  35.18 
 
 		 1019 aa  572  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1044 aa  556  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  33.04 
 
 		 1025 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  33.76 
 
 		 1046 aa  551  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  34.04 
 
 		 1053 aa  548  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 		 1046 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 		 1019 aa  545  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.17 
 
 		 1036 aa  540  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  31.66 
 
 		 1046 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 		 1046 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  32.91 
 
 		 1025 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  32.81 
 
 		 1016 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1021 aa  531  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 		 1041 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1048 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  31.92 
 
 		 1018 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  32.04 
 
 		 1049 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 		 1047 aa  532  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 		 1048 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  32.04 
 
 		 1049 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 		 1067 aa  531  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 		 1047 aa  529  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  31.66 
 
 		 1039 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 		 1036 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  32.3 
 
 		 1022 aa  523  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  32.7 
 
 		 1042 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  32.67 
 
 		 1045 aa  525  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1036 aa  525  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  31.59 
 
 		 1045 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1071 aa  525  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 		 1031 aa  525  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  32.21 
 
 		 1054 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1051 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.05 
 
 		 1027 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  31.82 
 
 		 1024 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  31.72 
 
 		 1050 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1021 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  32.04 
 
 		 1050 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 		 1023 aa  522  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 		 1018 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4708  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1020 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.3 
 
 		 1056 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1039 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  32.32 
 
 		 1060 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1017 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4339  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1020 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207307  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>