278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2309 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2309  periplasmic binding protein  100 
 
 		 358 aa  716    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66047  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  30.51 
 
 		 354 aa  122  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  30.54 
 
 		 483 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  29.23 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  28.49 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.03 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  25.32 
 
 		 409 aa  89.7  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25.24 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  24.61 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  29.14 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  28.3 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  25 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 318 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  26.58 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2455  periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1839  periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2450  periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.962038  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  24.32 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  22.13 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5781  ABC Fe3+siderophore/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  28.52 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  25.44 
 
 		 427 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  24.06 
 
 		 689 aa  67  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 361 aa  67  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3530  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.374472  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  27.34 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  24.4 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2366  periplasmic binding protein  29.77 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  24.64 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  27.82 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  24 
 
 		 688 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  28.7 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.41 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  24.51 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  24.23 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  23.71 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  21.58 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1923  periplasmic binding protein  27.19 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  26.48 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  27.49 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  25.89 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  27.49 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.49 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.49 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  21.47 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.49 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.49 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  27.33 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  25.34 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.27 
 
 		 406 aa  62.8  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  26.56 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  23.81 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0274  periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.880805  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.49 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  26.13 
 
 		 297 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  26.13 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  25.64 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2498  periplasmic binding protein  29.12 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.904872  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  31.53 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  28.3 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  24.74 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  21.65 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  22.64 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  22.63 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2078  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000011261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2307  Iron(III) dicitrate-binding protein  25.65 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0557705  normal  0.931308 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0844  periplasmic binding protein  28.63 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  23.95 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  23.41 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  25.24 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  23.41 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  25 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.88 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  25 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  24.21 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  21.6 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  26.47 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>