More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2156 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  59.64 
 
 		 667 aa  716    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  100 
 
 		 642 aa  1271    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  54.21 
 
 		 636 aa  648    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  54.3 
 
 		 644 aa  675    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  62.87 
 
 		 634 aa  778    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  56.11 
 
 		 628 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  64.73 
 
 		 651 aa  779    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  64.18 
 
 		 656 aa  798    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  53.63 
 
 		 658 aa  650    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  54.4 
 
 		 629 aa  607  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  50.7 
 
 		 656 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  52.17 
 
 		 629 aa  587  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  49.77 
 
 		 616 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  49.77 
 
 		 629 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  50.62 
 
 		 652 aa  564  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  50.83 
 
 		 645 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  48.53 
 
 		 623 aa  561  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  47.7 
 
 		 641 aa  558  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  50.31 
 
 		 616 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  48.47 
 
 		 639 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  49.92 
 
 		 657 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  51.24 
 
 		 624 aa  551  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  48.16 
 
 		 639 aa  548  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  48.3 
 
 		 632 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  43.45 
 
 		 699 aa  535  1e-151  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  42.14 
 
 		 718 aa  533  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  47.93 
 
 		 649 aa  534  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  48.7 
 
 		 640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  48.7 
 
 		 640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  48.7 
 
 		 640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  50.38 
 
 		 628 aa  514  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  47.52 
 
 		 627 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  47.4 
 
 		 647 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  48.56 
 
 		 629 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  48.43 
 
 		 655 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  47.19 
 
 		 648 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  53.35 
 
 		 700 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  44.48 
 
 		 932 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  28.86 
 
 		 626 aa  296  6e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.25 
 
 		 583 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  34.73 
 
 		 600 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  33.52 
 
 		 582 aa  279  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  33.99 
 
 		 595 aa  276  8e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  29.07 
 
 		 599 aa  276  8e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.22 
 
 		 587 aa  276  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  36.57 
 
 		 587 aa  271  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  34.78 
 
 		 588 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  36.53 
 
 		 618 aa  263  8.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 604 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  37.44 
 
 		 592 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  36.5 
 
 		 587 aa  257  4e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.09 
 
 		 605 aa  255  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  35.32 
 
 		 584 aa  254  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  29.52 
 
 		 590 aa  252  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  34.52 
 
 		 588 aa  253  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  37.38 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  36.08 
 
 		 655 aa  250  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  32.8 
 
 		 626 aa  250  6e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  33.4 
 
 		 599 aa  249  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  32.76 
 
 		 601 aa  249  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  29.83 
 
 		 590 aa  248  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  31.83 
 
 		 652 aa  248  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  39.31 
 
 		 641 aa  246  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  31.36 
 
 		 604 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  29.11 
 
 		 588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  35.31 
 
 		 592 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  33.26 
 
 		 593 aa  243  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  36.46 
 
 		 664 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  34.78 
 
 		 601 aa  243  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  35.87 
 
 		 647 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  33.76 
 
 		 581 aa  242  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  33.4 
 
 		 623 aa  242  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  33.62 
 
 		 655 aa  242  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  31.46 
 
 		 588 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  36.24 
 
 		 663 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  35.14 
 
 		 655 aa  241  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0757  DNA primase  36.57 
 
 		 647 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255391  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  33.76 
 
 		 581 aa  240  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.76 
 
 		 581 aa  240  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.76 
 
 		 581 aa  240  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.76 
 
 		 581 aa  240  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.76 
 
 		 581 aa  240  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  33.76 
 
 		 581 aa  240  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  35.44 
 
 		 663 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.15 
 
 		 613 aa  239  8e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  30.28 
 
 		 544 aa  239  9e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  33.11 
 
 		 585 aa  239  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  35.15 
 
 		 651 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  31.6 
 
 		 642 aa  239  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  34.07 
 
 		 656 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  33.46 
 
 		 651 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  28.41 
 
 		 595 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  33.58 
 
 		 595 aa  239  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  37.23 
 
 		 660 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  34.63 
 
 		 604 aa  238  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  33.55 
 
 		 581 aa  238  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  33.55 
 
 		 581 aa  238  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  34.5 
 
 		 652 aa  238  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  35.32 
 
 		 579 aa  237  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  34.73 
 
 		 660 aa  237  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>