More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0345 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
873 aa  1642    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  47.23 
 
 
861 aa  597  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  52.75 
 
 
866 aa  588  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  43.32 
 
 
873 aa  565  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  46.5 
 
 
853 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  38.62 
 
 
848 aa  419  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  36.82 
 
 
847 aa  386  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  36.57 
 
 
843 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  35.67 
 
 
842 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  35.42 
 
 
856 aa  365  3e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  37.32 
 
 
845 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  36.08 
 
 
834 aa  350  9e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  34.94 
 
 
859 aa  347  5e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  52.52 
 
 
857 aa  320  7e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  33.59 
 
 
849 aa  299  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  33.81 
 
 
849 aa  291  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 
852 aa  260  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  32.21 
 
 
855 aa  254  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  28.63 
 
 
854 aa  244  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 
861 aa  230  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 
853 aa  227  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  32.78 
 
 
806 aa  225  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  31.45 
 
 
838 aa  223  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  30.16 
 
 
836 aa  197  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  31.66 
 
 
841 aa  196  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  29.99 
 
 
821 aa  191  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  30.15 
 
 
825 aa  190  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  30.89 
 
 
839 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.55 
 
 
859 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  32.78 
 
 
828 aa  165  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 
853 aa  164  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  34.71 
 
 
855 aa  163  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  31.66 
 
 
846 aa  161  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.94 
 
 
930 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.99 
 
 
855 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  33.79 
 
 
871 aa  154  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  29.42 
 
 
880 aa  153  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  26.15 
 
 
854 aa  151  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.8 
 
 
863 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.82 
 
 
857 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.57 
 
 
835 aa  132  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  33.22 
 
 
857 aa  130  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.88 
 
 
858 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  26.02 
 
 
870 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 
855 aa  114  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  24.73 
 
 
850 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.77 
 
 
858 aa  112  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  30.04 
 
 
841 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 
849 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  20.49 
 
 
856 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 
878 aa  110  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26.74 
 
 
866 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  24.7 
 
 
850 aa  109  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  28.19 
 
 
897 aa  104  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  29.29 
 
 
852 aa  100  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  22.33 
 
 
849 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  31.14 
 
 
801 aa  93.2  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.71 
 
 
855 aa  92.8  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  26.22 
 
 
844 aa  89.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  19.86 
 
 
850 aa  82.4  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  30.31 
 
 
822 aa  82  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  20.37 
 
 
794 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  25.23 
 
 
413 aa  79.7  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  27.37 
 
 
838 aa  79.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  30.11 
 
 
827 aa  79  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  28.42 
 
 
828 aa  77.8  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  30.9 
 
 
843 aa  77  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  24.4 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  34.46 
 
 
453 aa  75.5  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  29.69 
 
 
807 aa  75.5  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1840  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.88 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  32.31 
 
 
842 aa  74.3  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  36.96 
 
 
842 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  30.29 
 
 
422 aa  74.3  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  30.34 
 
 
414 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  22.3 
 
 
393 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  31.98 
 
 
410 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  35.71 
 
 
443 aa  73.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  33.08 
 
 
842 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  28.9 
 
 
822 aa  72.4  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  27.74 
 
 
846 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  28.74 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  35.48 
 
 
452 aa  71.2  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 
857 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 
849 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  32.65 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.89 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  25.76 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  32.65 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.63 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01530  hypothetical protein  27.54 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  33.81 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  38.64 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  27.47 
 
 
884 aa  67.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  26.87 
 
 
885 aa  67.4  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  27.52 
 
 
867 aa  67  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  31.13 
 
 
462 aa  67.4  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  39.7 
 
 
846 aa  67  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  26.78 
 
 
396 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  28.5 
 
 
427 aa  67.4  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>