114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2557 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  358  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  56.11 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  55.08 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  61.39 
 
 		 169 aa  184  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  55.08 
 
 		 191 aa  184  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  60.37 
 
 		 183 aa  183  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  59.51 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  61.64 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  60.13 
 
 		 187 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  63.38 
 
 		 226 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  57.23 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  62.69 
 
 		 160 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 237 aa  168  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  58.87 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  56.29 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  56.29 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  59.85 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  55.94 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  51.77 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 169 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 169 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 172 aa  118  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  51.85 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  51.85 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 157 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 160 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 160 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 160 aa  92.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 160 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 160 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 160 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 160 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 160 aa  92  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 160 aa  92  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 158 aa  91.3  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 146 aa  91.3  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 160 aa  86.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 145 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  31.09 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  37.98 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  34.51 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 140 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 325 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 142 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 138 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 321 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 157 aa  45.1  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 157 aa  44.3  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 326 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0413  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.019986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 336 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 326 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 326 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 326 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  23.73 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 326 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>