More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0280 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  100 
 
 		 279 aa  542  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  60.43 
 
 		 281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  58.06 
 
 		 281 aa  310  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  59.07 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  59.64 
 
 		 283 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  58.16 
 
 		 303 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  57.91 
 
 		 281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  61.07 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  55.12 
 
 		 286 aa  278  7e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  55.96 
 
 		 279 aa  278  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  54.23 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  54.51 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  57.95 
 
 		 294 aa  261  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  54.84 
 
 		 286 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  54.12 
 
 		 286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  52.69 
 
 		 286 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  50 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  50.9 
 
 		 286 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  51.11 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  48.35 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  48.35 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  47.43 
 
 		 286 aa  225  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  48.33 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  48.52 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  46.79 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  47.37 
 
 		 278 aa  215  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  50.97 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  41.04 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  43.82 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  46.72 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  48.51 
 
 		 246 aa  188  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  44.19 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  44.2 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  43.07 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  41.34 
 
 		 271 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  40.94 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  39.86 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  34.19 
 
 		 245 aa  89  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  29.17 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  47.96 
 
 		 385 aa  85.5  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  27.4 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5440  NLP/P60 protein  28.94 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  28.57 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  26.79 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  23.73 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  32.49 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  27.43 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  27.73 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.19 
 
 		 556 aa  77  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  29.79 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  48.24 
 
 		 535 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  43.02 
 
 		 524 aa  69.3  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1813  NLP/P60 protein  26.24 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  40.91 
 
 		 368 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  31.56 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  32.32 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.43 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  33.03 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.46 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  44.16 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  25.86 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  25.86 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  25.86 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  26.57 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  25.86 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  42.7 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  25.43 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  25.86 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  25 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  26.57 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  26.76 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  34.62 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  41.89 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  32.71 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  36.54 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  39.58 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  40.96 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  31.46 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  35.58 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03360  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.01 
 
 		 580 aa  60.1  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  30.91 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  45.68 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  33.98 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  48.57 
 
 		 495 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  31.25 
 
 		 1048 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  41.76 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  37.96 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0007  nlp/p60 family protein  38.46 
 
 		 380 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0241644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  43.37 
 
 		 333 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  26.54 
 
 		 333 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  36.61 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1657  cell wall-associated hydrolase  34.38 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.388437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09120  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.2 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>