64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5179 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5179  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  100 
 
 		 1218 aa  2489    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252708  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  27.59 
 
 		 1200 aa  249  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.26 
 
 		 1181 aa  244  6e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.74 
 
 		 1223 aa  235  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.29 
 
 		 1227 aa  205  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.26 
 
 		 1155 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.8 
 
 		 1287 aa  187  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.11 
 
 		 1158 aa  177  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.52 
 
 		 1245 aa  160  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.53 
 
 		 1148 aa  145  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  25.27 
 
 		 1174 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  27.16 
 
 		 1069 aa  140  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  27.32 
 
 		 1309 aa  137  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  25.22 
 
 		 1521 aa  135  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  27.05 
 
 		 1470 aa  135  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.54 
 
 		 1115 aa  133  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  26.09 
 
 		 1254 aa  132  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  26.62 
 
 		 1214 aa  132  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  25.04 
 
 		 1521 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  27.06 
 
 		 1225 aa  130  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  26.62 
 
 		 1215 aa  129  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  26.62 
 
 		 1228 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  25.77 
 
 		 1581 aa  124  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  27.99 
 
 		 1014 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  24.16 
 
 		 1544 aa  122  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  27.49 
 
 		 1067 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1169 aa  116  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  23.76 
 
 		 1327 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1169 aa  110  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  27.57 
 
 		 991 aa  108  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1014 aa  107  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  23.96 
 
 		 1182 aa  105  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.49 
 
 		 1205 aa  103  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  22.34 
 
 		 1545 aa  100  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  27.2 
 
 		 1493 aa  98.6  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  25.32 
 
 		 1273 aa  97.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.49 
 
 		 1154 aa  94.7  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.72 
 
 		 1717 aa  92  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.56 
 
 		 1658 aa  91.7  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  25 
 
 		 1111 aa  87.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  23.85 
 
 		 1323 aa  85.5  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.93 
 
 		 1676 aa  79.7  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.28 
 
 		 1500 aa  78.2  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.87 
 
 		 1122 aa  77  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  23.53 
 
 		 798 aa  75.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  25.49 
 
 		 1127 aa  73.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.69 
 
 		 1122 aa  72  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.53 
 
 		 1517 aa  67.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  22.46 
 
 		 1378 aa  65.5  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  22.46 
 
 		 1378 aa  64.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.88 
 
 		 1182 aa  55.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.83 
 
 		 1216 aa  52.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  28.17 
 
 		 596 aa  49.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  22.46 
 
 		 1056 aa  48.9  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.55 
 
 		 1204 aa  48.5  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1090  type IV pilin biogenesis protein, putative  32.21 
 
 		 1194 aa  47  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2911  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  25.3 
 
 		 1078 aa  47  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1789  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1123 aa  47.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.72 
 
 		 1186 aa  46.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.97 
 
 		 1165 aa  45.8  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.2 
 
 		 1488 aa  46.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1216  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1255 aa  45.8  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  23.49 
 
 		 1212 aa  45.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2675  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein signal peptide  25.19 
 
 		 1070 aa  45.1  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>