More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3960 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  100 
 
 		 286 aa  591  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  86.62 
 
 		 280 aa  491  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1092  ABC transporter-related protein  88.76 
 
 		 274 aa  478  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  79.62 
 
 		 272 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  78.63 
 
 		 284 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  72.39 
 
 		 281 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  60.67 
 
 		 260 aa  322  5e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  52.21 
 
 		 267 aa  305  4.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3605  ABC transporter related  48.26 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  49.03 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2600  ABC transporter related  47.02 
 
 		 298 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0941  ABC transporter, ATPase subunit  47.27 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  46.01 
 
 		 284 aa  235  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  46.78 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  50 
 
 		 266 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  47.26 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  46.78 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  45.91 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  46.61 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  45.25 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  45.25 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 		 275 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  47.03 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  46.75 
 
 		 271 aa  218  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  42.86 
 
 		 269 aa  218  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  50.47 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  43.7 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.35 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  49.77 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  48.21 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  47.91 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  41.98 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  41.98 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  46.12 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  44.69 
 
 		 288 aa  205  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  41.85 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  46.19 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  45.09 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  44.19 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  46.02 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  45.8 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  40.58 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  43.6 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  45.18 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.12 
 
 		 254 aa  200  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  48.1 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  43.04 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  43.85 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  41.76 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  43.44 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  43.44 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  43.57 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  42.05 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  44.44 
 
 		 259 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  42.97 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.74 
 
 		 254 aa  195  7e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 261 aa  195  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.25 
 
 		 254 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  38.64 
 
 		 288 aa  194  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 261 aa  195  9e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  44.6 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.74 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.56 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.58 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.3 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.56 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  42.37 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  43.03 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  41.95 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  43.75 
 
 		 247 aa  193  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  42.24 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  42.37 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  46.51 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  41.05 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  44.3 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  44.24 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  43.36 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  38.95 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  41.85 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  43.05 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  44.74 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 		 254 aa  191  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  42.98 
 
 		 278 aa  191  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  43.31 
 
 		 261 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  42.62 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  42.8 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  41.9 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  46.01 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  43.61 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  42.92 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  41.1 
 
 		 259 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  48.83 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41 
 
 		 289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  45.58 
 
 		 284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  42.24 
 
 		 251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 		 259 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  45.58 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>