253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2271 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2271  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 		 502 aa  991    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  29.81 
 
 		 519 aa  204  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  32.82 
 
 		 533 aa  200  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  32.77 
 
 		 504 aa  194  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  32 
 
 		 519 aa  193  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  32.17 
 
 		 523 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  32.33 
 
 		 525 aa  187  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  32.25 
 
 		 522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  30.84 
 
 		 567 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  31.3 
 
 		 587 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  31.66 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  31.66 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  31.66 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  29.62 
 
 		 563 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  31.34 
 
 		 587 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  29.07 
 
 		 527 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  31.94 
 
 		 537 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  31.99 
 
 		 593 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  30.39 
 
 		 530 aa  181  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  31.12 
 
 		 677 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  29.2 
 
 		 527 aa  179  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  30.58 
 
 		 524 aa  179  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  30.62 
 
 		 579 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  33.59 
 
 		 518 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  29.8 
 
 		 528 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  30.38 
 
 		 579 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  30.38 
 
 		 579 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  30.38 
 
 		 579 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  38.43 
 
 		 565 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  30.38 
 
 		 576 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  30.75 
 
 		 537 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  31.12 
 
 		 598 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  32.23 
 
 		 524 aa  177  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  31.12 
 
 		 598 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  31.12 
 
 		 598 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  31.12 
 
 		 598 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  31.12 
 
 		 598 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  31.12 
 
 		 598 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  31.12 
 
 		 598 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.4 
 
 		 587 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  30.15 
 
 		 587 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.03 
 
 		 600 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  30.28 
 
 		 603 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  30.73 
 
 		 566 aa  172  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  29.1 
 
 		 538 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  29.88 
 
 		 552 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  29.88 
 
 		 552 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  29.88 
 
 		 552 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  29.88 
 
 		 552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  30.12 
 
 		 552 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  29.88 
 
 		 552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  35.12 
 
 		 569 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  30.25 
 
 		 539 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  27.56 
 
 		 500 aa  167  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0841  flagellar M-ring protein FliF  32.98 
 
 		 533 aa  167  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  35.12 
 
 		 568 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2575  flagellar MS-ring protein  35.54 
 
 		 574 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.1097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  29.26 
 
 		 576 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  29.65 
 
 		 570 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  29.65 
 
 		 570 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  33.47 
 
 		 569 aa  163  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  33.68 
 
 		 498 aa  162  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  26.55 
 
 		 539 aa  161  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  34.48 
 
 		 570 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  30.31 
 
 		 521 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  30.67 
 
 		 551 aa  160  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1394  flagellar M-ring protein FliF  36.4 
 
 		 533 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0124624  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  29.56 
 
 		 611 aa  160  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  29.56 
 
 		 611 aa  160  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  28.03 
 
 		 551 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  27.85 
 
 		 562 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  33.33 
 
 		 527 aa  158  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  27.3 
 
 		 548 aa  157  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  27.01 
 
 		 584 aa  156  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0849  flagellar M-ring protein FliF  28.83 
 
 		 540 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  28.47 
 
 		 567 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  28.64 
 
 		 571 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  37.13 
 
 		 576 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  34.47 
 
 		 586 aa  155  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2559  flagellar M-ring protein FliF  34.35 
 
 		 533 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00858256  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  28.88 
 
 		 588 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  33.6 
 
 		 568 aa  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  30.56 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  28.57 
 
 		 566 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  33.06 
 
 		 560 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  34.02 
 
 		 611 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2027  flagellar M-ring protein FliF  30.34 
 
 		 534 aa  151  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.506682 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  28.65 
 
 		 547 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  26.99 
 
 		 566 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  30.15 
 
 		 563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  30.1 
 
 		 580 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1668  flagellar MS-ring protein  26.38 
 
 		 567 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1693  flagellar M-ring protein FliF  27.25 
 
 		 503 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  28.5 
 
 		 574 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  32.92 
 
 		 564 aa  147  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  32.92 
 
 		 564 aa  147  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  29.76 
 
 		 567 aa  146  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  30.07 
 
 		 552 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  35.02 
 
 		 536 aa  146  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  27.99 
 
 		 561 aa  145  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>