More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03423 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  100 
 
 		 560 aa  1164    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  83.75 
 
 		 556 aa  969    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  96.61 
 
 		 560 aa  1103    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  46.88 
 
 		 551 aa  530  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  43.1 
 
 		 548 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  42.72 
 
 		 548 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  42.62 
 
 		 557 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  35.3 
 
 		 545 aa  337  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  34.4 
 
 		 627 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 597 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 		 559 aa  281  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  32.62 
 
 		 557 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 		 531 aa  265  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.78 
 
 		 552 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  31.23 
 
 		 567 aa  236  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  28.52 
 
 		 540 aa  219  7e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  29.71 
 
 		 554 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 		 562 aa  213  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  30.39 
 
 		 565 aa  213  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  30.15 
 
 		 567 aa  212  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  29.33 
 
 		 561 aa  211  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 557 aa  207  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 557 aa  207  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  30.49 
 
 		 568 aa  203  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.34 
 
 		 551 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  30.65 
 
 		 569 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 559 aa  200  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  29.39 
 
 		 576 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  28 
 
 		 547 aa  193  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 636 aa  190  7e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 560 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  27.88 
 
 		 579 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  28.38 
 
 		 572 aa  180  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.65 
 
 		 564 aa  179  9e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 		 553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.02 
 
 		 563 aa  159  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  27.26 
 
 		 609 aa  159  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 560 aa  156  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 		 565 aa  154  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 587 aa  153  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.13 
 
 		 563 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 		 568 aa  143  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  24.77 
 
 		 580 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  24.62 
 
 		 577 aa  136  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 604 aa  135  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 		 631 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 604 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 544 aa  127  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.22 
 
 		 562 aa  127  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.17 
 
 		 524 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 524 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 510 aa  120  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 559 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  25.73 
 
 		 537 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.31 
 
 		 542 aa  117  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  24.2 
 
 		 540 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.79 
 
 		 588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 522 aa  115  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.2 
 
 		 542 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 579 aa  114  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.7 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.43 
 
 		 609 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 		 629 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 510 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 522 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.86 
 
 		 626 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.9 
 
 		 572 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.32 
 
 		 587 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 527 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 544 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 		 534 aa  110  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 552 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 		 533 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 584 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 533 aa  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.34 
 
 		 589 aa  107  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.38 
 
 		 531 aa  107  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 		 607 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 544 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 		 532 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.96 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 		 531 aa  106  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  25.23 
 
 		 522 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  27.4 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.7 
 
 		 542 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 579 aa  105  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.95 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 		 522 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  24.1 
 
 		 526 aa  104  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 510 aa  103  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.41 
 
 		 539 aa  103  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 536 aa  103  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 		 512 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0715  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 565 aa  103  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>