More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01697 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  593  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  82.87 
 
 		 286 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  43.75 
 
 		 278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0050  thermoregulatory protein LcrF  41.86 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.24501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5908  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 286 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3677  transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 282 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.627004  normal  0.14963 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3827  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 235 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3940  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 235 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.423213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3914  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 235 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  26.89 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1958  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2262  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0123  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator (AraC family)  22.88 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.855779  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1991  helix-turn-helix domain-containing protein  23.79 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3749  helix-turn-helix domain-containing protein  23.55 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4462  transcriptional regulator, AraC family  25.47 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.981211  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3893  helix-turn-helix domain-containing protein  29.37 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0924  transcriptional regulator, AraC family  24.28 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489543  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1186  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1063  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.81783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6177  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0365179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0900  transcriptional regulator, AraC family  23.21 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899856  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  41 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  43.21 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5386  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1515  transcriptional regulator, AraC family  29.85 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5462  transcriptional regulator, AraC family  23.79 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.265033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20310  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.944905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4790  Helix-turn-helix, AraC domain protein  23.44 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.654902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2476  transcriptional regulator, AraC family  26.55 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5555  transcriptional regulator, AraC family  22.42 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.417705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  31.29 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1112  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 268 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3802  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.1 
 
 		 264 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00633295  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  26.96 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.23 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  35.05 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4428  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4999  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6017  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  24.85 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111213  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2283  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4142  transcriptional regulator, AraC family  24.6 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.776945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2435  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.996011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1303  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.239353  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 340 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 1201 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  23.19 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 154 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4437  transcriptional activator RhaS  28.39 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  37.18 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2833  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 128 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360969  hitchhiker  0.00326998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  34.07 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2369  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3385  transcriptional regulator, AraC family  21.53 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  24.68 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3775  AraC-like transcriptional regulator  25 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.04 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1001  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>