174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001355 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  100 
 
 		 218 aa  427  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  80.2 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  50.44 
 
 		 249 aa  174  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  38.46 
 
 		 269 aa  95.9  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  37.61 
 
 		 283 aa  86.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  31.95 
 
 		 252 aa  86.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  31.34 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  43.96 
 
 		 274 aa  85.5  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  39.81 
 
 		 291 aa  84.7  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  32.08 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  40.66 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  40.66 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  40.66 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  40.23 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  40.23 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  39.74 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  28.86 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  31.43 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  37.5 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  37.08 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  40.26 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  39.47 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  40.26 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  45.45 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  32.03 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  39.53 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.75 
 
 		 112 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  36.84 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  35.06 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  35.9 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  24.75 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  39.24 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  29.47 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  30.45 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  34.12 
 
 		 443 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  33.77 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  36.84 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  33.33 
 
 		 115 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  36.47 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  36.84 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  35.29 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  37.66 
 
 		 277 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  38.96 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  34.18 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  38.55 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  33.72 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  33.33 
 
 		 368 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  38.1 
 
 		 349 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  34.62 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  36.36 
 
 		 275 aa  52.8  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  35.9 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  37.66 
 
 		 273 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  41.03 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  35 
 
 		 255 aa  52  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  32.1 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  35.9 
 
 		 507 aa  51.6  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  35.8 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  33.33 
 
 		 121 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  31.13 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  33.71 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  32.91 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  29.11 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  31.08 
 
 		 265 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  33.33 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  32.47 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  32.47 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  31.46 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  33.75 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  29.87 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  35.44 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  37.8 
 
 		 441 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  36 
 
 		 258 aa  48.9  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  32.58 
 
 		 266 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  36.36 
 
 		 266 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  31.58 
 
 		 137 aa  48.1  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  33.33 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  34.18 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  28.64 
 
 		 324 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  38.18 
 
 		 110 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3575  TonB family protein  30.84 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  28.87 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  34.62 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  36.23 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  39.29 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  30.34 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  34.62 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  30.34 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  29.92 
 
 		 342 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  31.33 
 
 		 565 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  34.62 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  32.05 
 
 		 117 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  37.66 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  30.26 
 
 		 137 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  30.16 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  41.94 
 
 		 392 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  30.68 
 
 		 283 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  35.9 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  36.25 
 
 		 305 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  34.62 
 
 		 286 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>