More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001295 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5370  oxidoreductase-related protein  71.53 
 
 		 442 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001295  glycine/D-amino acid oxidase  100 
 
 		 438 aa  910    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4112  FAD dependent oxidoreductase  41.97 
 
 		 439 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1374  FAD dependent oxidoreductase  43.19 
 
 		 439 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09750  putative oxidoreductase  41.91 
 
 		 439 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2818  FAD dependent oxidoreductase  42.56 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  40.27 
 
 		 437 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  38.53 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 		 437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2113  putative oxidoreductase protein  41.71 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0578145  normal  0.36209 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6865  FAD dependent oxidoreductase  35.91 
 
 		 443 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5757  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 443 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4836  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 448 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458657 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7256  oxidoreductase  32.88 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5280  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 448 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4822  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 448 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537727  normal  0.272998 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4774  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952242  normal  0.115123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3065  hypothetical protein  32.57 
 
 		 448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0139193  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4005  oxidoreductase, NAD-binding site  31.59 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0756508  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4751  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1106  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  28 
 
 		 473 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  27.84 
 
 		 464 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 459 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 457 aa  133  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 480 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 		 482 aa  123  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 425 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 425 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 424 aa  113  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 425 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  25.71 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 443 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 431 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  25.17 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  27.12 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 477 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  26.03 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  26.12 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 437 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 426 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 		 433 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  26.03 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  26.84 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 491 aa  103  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  28.21 
 
 		 439 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  23.68 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  22.82 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 443 aa  100  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  23.82 
 
 		 428 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 487 aa  100  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  23.82 
 
 		 428 aa  100  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 433 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 436 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 428 aa  99.8  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  28.37 
 
 		 489 aa  99.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>