More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0303 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0303  AraC/XylS family transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  549  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  82.06 
 
 		 276 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  83.33 
 
 		 240 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0401  putative transcriptional regulator, AraC family  58.66 
 
 		 264 aa  330  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0925  AraC family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0926  AraC family transcriptional regulator  55.73 
 
 		 259 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0961  AraC family transcriptional regulator  55.73 
 
 		 259 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1092  AraC/XylS family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 259 aa  299  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3380  transcriptional regulator, AraC family  56.13 
 
 		 258 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0910  helix-turn-helix domain-containing protein  55.73 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3577  AraC family transcriptional regulator  55.73 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.186564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3453  helix-turn-helix domain-containing protein  55.73 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0927  helix-turn-helix domain-containing protein  51.18 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 261 aa  245  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 261 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 261 aa  242  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1611  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  43.53 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 		 264 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3337  AraC family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0516036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02197  transcriptional regulator transcription regulator protein  40.42 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 257 aa  198  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 277 aa  191  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4920  transcriptional regulator, AraC family  37.6 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4730  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3843  transcriptional regulator, AraC family  37.6 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.419049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4852  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4644  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422657  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4909  AraC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 273 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3559  transcriptional regulator, AraC family  28.29 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  34.45 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 261 aa  131  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 272 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  30.4 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  32.54 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  32.89 
 
 		 272 aa  128  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  32.39 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 268 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  29.65 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 256 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 273 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  27 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  32.03 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  31.56 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.11 
 
 		 273 aa  118  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 278 aa  118  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 273 aa  118  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  27.57 
 
 		 281 aa  118  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  31.11 
 
 		 273 aa  118  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  28.69 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0610  helix-turn-helix, AraC type  28.83 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  27.03 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>