More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1014 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1116  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1014  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0985  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.89 
 
 
212 aa  245  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1525  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.07 
 
 
214 aa  232  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.13 
 
 
218 aa  221  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1306  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 
214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0153242  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1281  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 
214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.31 
 
 
221 aa  218  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.91 
 
 
216 aa  215  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.44 
 
 
218 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.36 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.36 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.36 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.36 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.36 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.36 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.37 
 
 
232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.36 
 
 
214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.36 
 
 
214 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.36 
 
 
214 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.01 
 
 
222 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase (D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)  47.14 
 
 
217 aa  211  7e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00660357  normal  0.751371 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1319  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.25 
 
 
229 aa  210  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.91 
 
 
217 aa  210  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1908  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.33 
 
 
219 aa  210  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000189819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.89 
 
 
214 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 
214 aa  209  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.91 
 
 
217 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.92 
 
 
224 aa  207  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.07 
 
 
220 aa  207  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 
221 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.54 
 
 
227 aa  206  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.87 
 
 
219 aa  206  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.41 
 
 
221 aa  204  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.41 
 
 
221 aa  204  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.49 
 
 
219 aa  204  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0788  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
214 aa  203  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5109  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
215 aa  202  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0277689  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.05 
 
 
224 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.25 
 
 
221 aa  201  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0731  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.93 
 
 
224 aa  201  9e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0365158  normal  0.685056 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.29 
 
 
220 aa  201  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 
219 aa  200  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.25 
 
 
234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 
236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.53 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2540  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.41 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.8 
 
 
230 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.6 
 
 
219 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 
247 aa  199  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.95 
 
 
221 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 
221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.17 
 
 
221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
221 aa  198  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0049  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.93 
 
 
222 aa  197  7e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.6 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0481  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.53 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.76 
 
 
222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.87 
 
 
221 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2057  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
231 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.725106 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  44.08 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.84 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.64 
 
 
235 aa  195  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.64 
 
 
235 aa  195  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2632  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.53 
 
 
217 aa  194  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1432  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
220 aa  195  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
218 aa  195  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.79 
 
 
221 aa  194  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 
224 aa  194  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 
224 aa  194  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.04 
 
 
234 aa  194  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.04 
 
 
234 aa  194  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
221 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.13 
 
 
223 aa  192  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.73 
 
 
238 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1595  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.65 
 
 
218 aa  192  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0082  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 
228 aa  192  4e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 
225 aa  192  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.08 
 
 
228 aa  191  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1858  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 
230 aa  191  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.19 
 
 
221 aa  191  7e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.54 
 
 
220 aa  191  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.24 
 
 
224 aa  191  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0333  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.13 
 
 
216 aa  191  9e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.540612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.25 
 
 
217 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.01 
 
 
235 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.42 
 
 
211 aa  190  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0977  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.76 
 
 
219 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213833 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1649  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.19 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.23 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  44.29 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.93 
 
 
231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1434  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.38 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.12 
 
 
224 aa  188  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.7 
 
 
225 aa  187  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.15 
 
 
225 aa  187  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  42.47 
 
 
265 aa  187  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.47 
 
 
225 aa  186  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>