127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2184 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2184  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1017  isochorismatase hydrolase  35.37 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  32.81 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7071  isochorismatase hydrolase  35.91 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00539023  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0201  isochorismatase hydrolase  37.17 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  28.75 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  29.32 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  25.71 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  27.44 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  27.44 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  27.44 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  27.44 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  27.44 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  27.1 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2619  isochorismatase hydrolase  28.91 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  37.93 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  31.64 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5057  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  40.74 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 246 aa  48.9  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4299  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  27.69 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 215 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  47.06 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3001  isochorismatase hydrolase  38.33 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  29.08 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  28.68 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  30.33 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  24.88 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  25.57 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0757  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000750492  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  28.82 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  28.16 
 
 		 227 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  37.5 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  27.7 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3939  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136156 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 248 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  28.66 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  24.88 
 
 		 239 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  25.62 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1294  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  27.27 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  34.07 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  25.83 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  25.83 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  27.01 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  25.26 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  28.67 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  27.34 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  28.12 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  27.21 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1968  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.76 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  24.31 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  27.95 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  30.33 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  25.42 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  22.41 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 		 241 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>