151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1602 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  100 
 
 		 293 aa  554  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  47.59 
 
 		 296 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  47.59 
 
 		 296 aa  278  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  43.54 
 
 		 294 aa  229  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  29.87 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  31.68 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  29.35 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  32.29 
 
 		 297 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  31.94 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  24.24 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  26.03 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  32.41 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  27.72 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  29.47 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  26.81 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  22.98 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  24.05 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  22.74 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  28.69 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  29.74 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  20.82 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  29.13 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  25.49 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  22.67 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  23.57 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  29.38 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  24.22 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  24.9 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  25.76 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  29.47 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  23.53 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  21.83 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  21.98 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  21.25 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  27.4 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  30.24 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  22.82 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  25.75 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  27.09 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  25.95 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  21.74 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  28.21 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  27.2 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.18 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.18 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  23.65 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  26.18 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  27.97 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  24.66 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  26.7 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  24.55 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.11 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.01 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0742  Auxin Efflux Carrier  28.76 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.678682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  20.77 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  22.11 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  26.94 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  26.03 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  21.15 
 
 		 316 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  24.3 
 
 		 326 aa  52.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  19.66 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  22.27 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  25.63 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  22.67 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  22.67 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  25.7 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  25.59 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  23.67 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  24.17 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  22.01 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0840  auxin efflux carrier  22.3 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0605901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  22.7 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  23.1 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  22.43 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  19.34 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  19.42 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  21.55 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  19.91 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  24.79 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  23.94 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  21.76 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  27.01 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  21.55 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  21.76 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  23.11 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  22.78 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  23.08 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  21.3 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  26.6 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  21.76 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  22.69 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  25.64 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  28.1 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>