255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0476 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0476  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 		 489 aa  983    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.218102  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0834  flagellar M-ring protein FliF  59.59 
 
 		 535 aa  603  1.0000000000000001e-171  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000164203  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0703  flagellar M-ring protein FliF  50.71 
 
 		 532 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408742  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0727  flagellar M-ring protein FliF  50.51 
 
 		 532 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.425125  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1373  flagellar M-ring protein FliF  39.43 
 
 		 516 aa  301  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.522807  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  29.88 
 
 		 518 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  33.06 
 
 		 524 aa  186  9e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1693  flagellar M-ring protein FliF  31.25 
 
 		 503 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  34.03 
 
 		 519 aa  182  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  36 
 
 		 536 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  27.67 
 
 		 598 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  33.23 
 
 		 677 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  26.93 
 
 		 569 aa  181  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  27.48 
 
 		 598 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  27.48 
 
 		 598 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  34.41 
 
 		 587 aa  180  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  30.22 
 
 		 519 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  28.37 
 
 		 523 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  32.74 
 
 		 587 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  27.53 
 
 		 525 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  33.73 
 
 		 603 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  33.82 
 
 		 587 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  27.63 
 
 		 522 aa  176  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  34.12 
 
 		 587 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  34.12 
 
 		 587 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  34.12 
 
 		 587 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  33.53 
 
 		 587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  34.86 
 
 		 552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  27.1 
 
 		 598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  33.05 
 
 		 524 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  27.1 
 
 		 598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  27.1 
 
 		 598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  27.1 
 
 		 598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  32.84 
 
 		 600 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  33.91 
 
 		 552 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  30.52 
 
 		 521 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  33.91 
 
 		 552 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  33.91 
 
 		 552 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  34.57 
 
 		 552 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  34.38 
 
 		 552 aa  172  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  32.95 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  32.95 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  32.95 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  32.95 
 
 		 576 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2575  flagellar MS-ring protein  38.04 
 
 		 574 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.1097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  37.65 
 
 		 569 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  34.42 
 
 		 593 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  29.15 
 
 		 537 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  32.67 
 
 		 579 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  33.14 
 
 		 498 aa  170  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  33.24 
 
 		 563 aa  170  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  26.95 
 
 		 540 aa  169  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  28.12 
 
 		 538 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  33.13 
 
 		 530 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  35.28 
 
 		 533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  32.75 
 
 		 571 aa  167  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  33.03 
 
 		 527 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  26.21 
 
 		 576 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  31.06 
 
 		 570 aa  166  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  31.06 
 
 		 570 aa  166  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  27.47 
 
 		 539 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  36.2 
 
 		 570 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  36.34 
 
 		 504 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  32.84 
 
 		 566 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  28.22 
 
 		 568 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  25.98 
 
 		 548 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  30 
 
 		 564 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  27.67 
 
 		 538 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  30 
 
 		 564 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  31.48 
 
 		 565 aa  161  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  25.98 
 
 		 541 aa  160  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  29.84 
 
 		 567 aa  160  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  26.98 
 
 		 528 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  26.2 
 
 		 537 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  27.47 
 
 		 535 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  26.04 
 
 		 588 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  32.22 
 
 		 530 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  26.64 
 
 		 611 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  26.22 
 
 		 567 aa  158  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  26.64 
 
 		 611 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  36.49 
 
 		 611 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  29.8 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  30.21 
 
 		 566 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  35.19 
 
 		 551 aa  157  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  27.87 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  26.68 
 
 		 539 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  28.28 
 
 		 562 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  30.1 
 
 		 568 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  36.29 
 
 		 586 aa  156  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  30.39 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  31.18 
 
 		 580 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  27.76 
 
 		 539 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  27.4 
 
 		 520 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  31.8 
 
 		 525 aa  153  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  30.89 
 
 		 527 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  28.23 
 
 		 590 aa  152  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  30.88 
 
 		 539 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  27.89 
 
 		 569 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  27.74 
 
 		 532 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0841  flagellar M-ring protein FliF  27.63 
 
 		 533 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>