133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2270 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  100 
 
 		 1304 aa  2551    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  33.55 
 
 		 1300 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1284 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1309 aa  357  7.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1288 aa  352  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1307 aa  346  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1261 aa  321  5e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1301 aa  304  7.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1384 aa  297  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1341 aa  296  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1265 aa  295  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1264 aa  284  6.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1273 aa  284  9e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1283 aa  283  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1273 aa  281  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1269 aa  274  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1276 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1274 aa  271  5e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1306 aa  271  8e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1286 aa  271  8e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1275 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1271 aa  266  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  22.76 
 
 		 1301 aa  265  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1273 aa  264  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1271 aa  262  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1266 aa  262  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1266 aa  260  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1266 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1266 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1266 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1266 aa  258  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1266 aa  258  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1266 aa  257  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  24.77 
 
 		 1266 aa  257  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1277 aa  256  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  24.51 
 
 		 1266 aa  256  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1266 aa  256  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1266 aa  256  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1266 aa  255  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1266 aa  256  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1267 aa  254  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1379 aa  253  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1271 aa  253  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  26.11 
 
 		 1450 aa  252  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1420 aa  248  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1381 aa  247  9e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1378 aa  247  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.95 
 
 		 1346 aa  245  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1265 aa  243  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1419 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1394 aa  241  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1399 aa  240  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1276 aa  238  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  21.36 
 
 		 1323 aa  238  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1271 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1397 aa  237  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  21.05 
 
 		 1443 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1266 aa  237  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  21.2 
 
 		 1331 aa  236  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1276 aa  236  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1141 aa  236  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  26.17 
 
 		 1273 aa  236  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1399 aa  235  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1397 aa  235  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1305 aa  234  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1397 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  21.26 
 
 		 1439 aa  234  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1399 aa  233  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1419 aa  233  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1454 aa  233  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1441 aa  232  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1397 aa  231  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1398 aa  231  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1399 aa  231  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1399 aa  230  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1446 aa  230  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  20.7 
 
 		 1287 aa  229  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1459 aa  229  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1372 aa  229  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1291 aa  229  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1368 aa  228  8e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1397 aa  228  8e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1397 aa  228  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1398 aa  227  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1284 aa  227  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1430 aa  225  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1416 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1383 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  21.27 
 
 		 1392 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  21.33 
 
 		 1417 aa  213  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1436 aa  213  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  24.51 
 
 		 1426 aa  212  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1426 aa  210  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1428 aa  210  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1398 aa  205  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1277 aa  204  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1290 aa  202  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1426 aa  202  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  20.95 
 
 		 1380 aa  192  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  20.6 
 
 		 1419 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>