More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2479 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 375 aa  764    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  78.92 
 
 		 372 aa  618  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  76.68 
 
 		 378 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  74.8 
 
 		 378 aa  579  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  73.84 
 
 		 372 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  73.61 
 
 		 369 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  67.86 
 
 		 367 aa  514  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  65.94 
 
 		 373 aa  511  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  65.07 
 
 		 373 aa  511  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  67.31 
 
 		 369 aa  511  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  66.67 
 
 		 368 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  64.78 
 
 		 372 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  64.77 
 
 		 368 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  64.42 
 
 		 371 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  64.42 
 
 		 371 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  64.15 
 
 		 371 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  67.6 
 
 		 370 aa  487  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  62.09 
 
 		 367 aa  481  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  67.14 
 
 		 368 aa  481  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  63.43 
 
 		 371 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  61.56 
 
 		 371 aa  475  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  62.09 
 
 		 369 aa  472  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  62.92 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  65.48 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  62.94 
 
 		 374 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  61.1 
 
 		 370 aa  465  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  61.05 
 
 		 371 aa  463  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  60.22 
 
 		 371 aa  461  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  60.43 
 
 		 372 aa  461  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  64.59 
 
 		 376 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  59.36 
 
 		 371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  60 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  61.87 
 
 		 378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  64.48 
 
 		 386 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  56.53 
 
 		 373 aa  437  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  61.67 
 
 		 375 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  55.08 
 
 		 378 aa  434  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  56.68 
 
 		 374 aa  430  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  53.04 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  49.59 
 
 		 383 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  50.7 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  51.63 
 
 		 377 aa  360  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50.85 
 
 		 366 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  51.55 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  47.93 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  48.62 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  53.07 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  49.73 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  48.13 
 
 		 373 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  50.57 
 
 		 378 aa  342  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  47.44 
 
 		 372 aa  342  7e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  49.57 
 
 		 364 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  47.78 
 
 		 367 aa  339  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  46.91 
 
 		 369 aa  338  5.9999999999999996e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  51.34 
 
 		 356 aa  338  8e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  55.14 
 
 		 330 aa  338  8e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  47.18 
 
 		 369 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  47.29 
 
 		 357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  47.19 
 
 		 368 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  45.45 
 
 		 372 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  47.86 
 
 		 362 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 356 aa  333  4e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  46.5 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  49.23 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  48.2 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  47.58 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  44.96 
 
 		 367 aa  329  6e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  48.24 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  45.23 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  47.11 
 
 		 365 aa  325  5e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  47.11 
 
 		 365 aa  325  6e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  47.11 
 
 		 365 aa  325  6e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  47.11 
 
 		 365 aa  325  6e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  48.8 
 
 		 369 aa  325  7e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  49.24 
 
 		 341 aa  325  8.000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  50.48 
 
 		 317 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  47.16 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  44.17 
 
 		 367 aa  323  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  46.83 
 
 		 365 aa  322  6e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  48.5 
 
 		 356 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  45 
 
 		 380 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  46.28 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  49.26 
 
 		 375 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  48.02 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  49.69 
 
 		 330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  47.09 
 
 		 364 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  44.72 
 
 		 380 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  44.41 
 
 		 364 aa  318  1e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  46.92 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  48.92 
 
 		 375 aa  317  2e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  47.21 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  45.73 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  47.04 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  44.72 
 
 		 380 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 		 359 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  46.01 
 
 		 365 aa  316  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3345  peptide chain release factor 2  53.23 
 
 		 317 aa  315  6e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.219994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  44.44 
 
 		 380 aa  315  7e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>