More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0742 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0742  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  100 
 
 		 310 aa  627  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.666239  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41.35 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  34.29 
 
 		 523 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  36.21 
 
 		 195 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  36.27 
 
 		 631 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  38.46 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3027  OmpA/MotB domain-containing protein  33.88 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3170  OmpA/MotB domain-containing protein  33.88 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000129051  hitchhiker  0.0000476695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3012  OmpA/MotB domain-containing protein  33.88 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000126863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1351  OmpA/MotB domain protein  33.88 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000530028  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  27.55 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  28.28 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  37.38 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.91 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  32.5 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  32.23 
 
 		 587 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  36.19 
 
 		 524 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 189 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  31.34 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4321  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.78 
 
 		 605 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  33.77 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  32.71 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  27.27 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000882937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2141  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 520 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0276844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  40.85 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  42.03 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  31.45 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  38.1 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  34.65 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  25.96 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  38.1 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  36.05 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3761  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 		 584 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.36 
 
 		 584 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  30.17 
 
 		 466 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  42.67 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  38.82 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  38.82 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  38.82 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.01 
 
 		 707 aa  59.3  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  42.03 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  42.25 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  42.25 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  41.33 
 
 		 269 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  26.55 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  32.67 
 
 		 669 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  40 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  38.82 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  42.05 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  29.13 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  31.9 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  33.93 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  31.9 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  32.71 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  44.44 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  46.38 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.65 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  28.74 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0311  OmpA/MotB  27.74 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  46.38 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  32.69 
 
 		 216 aa  57  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  40.58 
 
 		 459 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  30.36 
 
 		 433 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  35.23 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.85 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  38.04 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  40.48 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  32.84 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  31.9 
 
 		 560 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  36.36 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.25 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3934  OmpA/MotB domain protein  37.97 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000488148  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  39.77 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  34.67 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>