More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4321 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4321  OmpA/MotB family outer membrane protein  100 
 
 
605 aa  1253    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 
220 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  43.33 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5086  OmpA/MotB domain protein  26.67 
 
 
533 aa  74.7  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 
220 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  44.83 
 
 
231 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  42.45 
 
 
220 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 
220 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  39.05 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  39.13 
 
 
1619 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  39.81 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  40.95 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.62 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0587  outer membrane protein, OmpA family  31.82 
 
 
212 aa  67  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536504  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  41.94 
 
 
344 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.1 
 
 
248 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  40.95 
 
 
464 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 
222 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  41.94 
 
 
344 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 
221 aa  65.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  41.94 
 
 
344 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  35.25 
 
 
264 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  48.65 
 
 
218 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  40.57 
 
 
463 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  41.94 
 
 
345 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  35.78 
 
 
424 aa  66.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  46.75 
 
 
219 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 
229 aa  65.1  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  46.51 
 
 
210 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  40.19 
 
 
222 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  46.51 
 
 
210 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  39.81 
 
 
241 aa  64.7  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
227 aa  64.3  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  46.05 
 
 
569 aa  64.3  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 
224 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2804  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 
215 aa  63.9  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
239 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  40.86 
 
 
344 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.86 
 
 
344 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.38 
 
 
220 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 
388 aa  63.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 
228 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  32.64 
 
 
260 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.58 
 
 
240 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  39.78 
 
 
344 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  33.65 
 
 
333 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 
221 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 
219 aa  62.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 
221 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  38.94 
 
 
227 aa  63.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  37.14 
 
 
326 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.17 
 
 
261 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 
217 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.39 
 
 
407 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  37.86 
 
 
221 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  44.16 
 
 
222 aa  63.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  37.74 
 
 
694 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  37.14 
 
 
235 aa  62.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.17 
 
 
261 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  35.85 
 
 
337 aa  62  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 
243 aa  62  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  36.96 
 
 
294 aa  62  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 
261 aa  62  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  32.54 
 
 
261 aa  62  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
304 aa  62  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 
224 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 
228 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  35.11 
 
 
205 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 
210 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.3 
 
 
214 aa  61.6  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 
237 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 
229 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  38.89 
 
 
321 aa  61.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  36.43 
 
 
215 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  39.05 
 
 
261 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  36.43 
 
 
215 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  39.8 
 
 
241 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.43 
 
 
215 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.5 
 
 
351 aa  60.8  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  41.3 
 
 
210 aa  60.8  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  32.64 
 
 
260 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 
220 aa  60.8  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  38.38 
 
 
219 aa  60.8  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  36.43 
 
 
215 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  41.3 
 
 
242 aa  60.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 
175 aa  60.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 
238 aa  60.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 
216 aa  60.5  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  41.76 
 
 
215 aa  60.5  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 
216 aa  60.5  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 
224 aa  60.5  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>