More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3691 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  100 
 
 
338 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  67.08 
 
 
350 aa  394  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  42.64 
 
 
365 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  40.36 
 
 
362 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  37.84 
 
 
357 aa  239  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  39.09 
 
 
352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  39.16 
 
 
442 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  38.97 
 
 
371 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  41.52 
 
 
344 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  39.14 
 
 
373 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  42.2 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  40.12 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  40.12 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  39.46 
 
 
391 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  37.65 
 
 
364 aa  205  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  38.68 
 
 
451 aa  205  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
357 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  38.11 
 
 
365 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  39.29 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  41.18 
 
 
454 aa  195  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  41.61 
 
 
365 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  36.58 
 
 
354 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  36.58 
 
 
354 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  41.42 
 
 
365 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  34.65 
 
 
349 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  37.87 
 
 
349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  34.86 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  40.43 
 
 
471 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  38.91 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  36.72 
 
 
426 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.38 
 
 
349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  36.34 
 
 
347 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.35 
 
 
347 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  36.98 
 
 
349 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  42.07 
 
 
379 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  33.43 
 
 
377 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  33.04 
 
 
365 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  36.81 
 
 
352 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  34.02 
 
 
364 aa  175  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  34.43 
 
 
340 aa  175  8e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  35.59 
 
 
372 aa  175  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  33.94 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  31.76 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  32.93 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1592  inner-membrane translocator  36.02 
 
 
334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  34.45 
 
 
360 aa  172  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  32.08 
 
 
368 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  36.28 
 
 
334 aa  172  5e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  31.76 
 
 
366 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  32.84 
 
 
376 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  31.58 
 
 
359 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  38.49 
 
 
462 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  36.42 
 
 
347 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  34.38 
 
 
365 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  35.6 
 
 
376 aa  170  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  37.86 
 
 
417 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  31.44 
 
 
360 aa  169  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  32.55 
 
 
372 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  43.01 
 
 
408 aa  168  9e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  34.84 
 
 
366 aa  168  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  34.76 
 
 
358 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  34.95 
 
 
352 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  34.57 
 
 
364 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  37.83 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  34.11 
 
 
361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  33.62 
 
 
363 aa  166  5e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  32.95 
 
 
403 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  31.95 
 
 
367 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  34.99 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  35.16 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  33.53 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  39.29 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  33.82 
 
 
365 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.15 
 
 
373 aa  163  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  35.78 
 
 
349 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  32.09 
 
 
357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  36.7 
 
 
356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  35.78 
 
 
349 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  30.84 
 
 
364 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  34.86 
 
 
369 aa  162  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  36.9 
 
 
348 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 
352 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  36.64 
 
 
352 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  31.75 
 
 
353 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 
352 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1646  inner-membrane translocator  35.95 
 
 
335 aa  159  7e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.12829  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  34.86 
 
 
367 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  31.1 
 
 
367 aa  159  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.33 
 
 
360 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  32.7 
 
 
358 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  34.29 
 
 
369 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  33.96 
 
 
364 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  34.13 
 
 
361 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  34.86 
 
 
388 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  36.77 
 
 
349 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  32.42 
 
 
360 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  34.29 
 
 
369 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  31.38 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  34.65 
 
 
369 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  32.65 
 
 
377 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>