More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4142 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8203  type II secretion system protein E  81.41 
 
 		 442 aa  671    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  100 
 
 		 433 aa  865    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  84.99 
 
 		 433 aa  729    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  72.98 
 
 		 448 aa  613  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  54.57 
 
 		 437 aa  428  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2762  type II secretion system protein E  52.05 
 
 		 452 aa  388  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0831421  hitchhiker  0.00208523 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4729  type II secretion system protein E  49.88 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4644  type II secretion system protein E  46.3 
 
 		 452 aa  342  9e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  52.46 
 
 		 431 aa  326  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  48.19 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0671  type II secretion system protein E  45.57 
 
 		 471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1736  type II secretion system protein E  48.36 
 
 		 481 aa  312  6.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00343122  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2594  type II secretion system protein E  48.52 
 
 		 483 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  45.5 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1223  type II secretion system protein E  45.77 
 
 		 452 aa  299  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4970  type II secretion system protein E  40.94 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297682  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4457  type II secretion system protein E  40.27 
 
 		 508 aa  254  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0842  type II secretion system protein E  38.46 
 
 		 466 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0127563  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3419  type II secretion system protein E  37.33 
 
 		 523 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  36.78 
 
 		 444 aa  223  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  38.4 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  36.16 
 
 		 479 aa  210  5e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  35.19 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8746  type II secretion system protein E  35.45 
 
 		 692 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.400564 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  39.83 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  37.47 
 
 		 447 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  37.19 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  37.19 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  37.19 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  37.47 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2222  type II secretion system protein E  34.01 
 
 		 559 aa  203  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 473 aa  203  5e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  37.09 
 
 		 454 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  37.47 
 
 		 455 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  37.47 
 
 		 447 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  37.47 
 
 		 447 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  37.47 
 
 		 447 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  32.85 
 
 		 472 aa  202  9e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  37.19 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  37.02 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  37.02 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  32.95 
 
 		 456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  35.34 
 
 		 477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  32.55 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  38.65 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  38.94 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  38.94 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  34.97 
 
 		 454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  36.89 
 
 		 463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  34.4 
 
 		 459 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  35.14 
 
 		 572 aa  199  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  41.62 
 
 		 387 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  36.89 
 
 		 465 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  34.76 
 
 		 478 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  33.58 
 
 		 569 aa  199  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  38.25 
 
 		 440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  36.6 
 
 		 468 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  39.44 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  35.05 
 
 		 487 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  34.49 
 
 		 455 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  35.14 
 
 		 624 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  34.49 
 
 		 455 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  35.97 
 
 		 454 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  35.97 
 
 		 454 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  35.66 
 
 		 639 aa  196  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  35.97 
 
 		 454 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.31 
 
 		 455 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  37.24 
 
 		 634 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  37.89 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  36.36 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  39.29 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  36.78 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  33.7 
 
 		 469 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  34.87 
 
 		 460 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  36.81 
 
 		 432 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  34.66 
 
 		 485 aa  193  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 		 563 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  38.48 
 
 		 478 aa  192  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  36.23 
 
 		 474 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  36.89 
 
 		 445 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  34.95 
 
 		 454 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  38.1 
 
 		 463 aa  192  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  36.05 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  34.68 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  33.33 
 
 		 589 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  38.26 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  34.7 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  37.13 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  36.58 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  36.67 
 
 		 594 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  34.67 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 455 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  35.99 
 
 		 483 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  33.75 
 
 		 455 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  34.83 
 
 		 474 aa  190  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  33.75 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  36.08 
 
 		 458 aa  189  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  33.61 
 
 		 442 aa  189  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  34.96 
 
 		 521 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>