More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3182 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 1029 aa  2064    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  38.72 
 
 		 1041 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  42.01 
 
 		 1062 aa  726    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  36.86 
 
 		 1017 aa  645    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  38.96 
 
 		 982 aa  653    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  56.72 
 
 		 1035 aa  1103    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  42.93 
 
 		 1066 aa  663    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  44.06 
 
 		 1033 aa  768    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  45.27 
 
 		 1051 aa  818    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  37.13 
 
 		 1055 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  40.76 
 
 		 1058 aa  663    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  37.07 
 
 		 1061 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  44.47 
 
 		 1063 aa  793    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  48.23 
 
 		 1031 aa  805    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  48.38 
 
 		 1033 aa  897    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  43.78 
 
 		 1033 aa  748    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  37.23 
 
 		 1055 aa  659    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  38.22 
 
 		 1043 aa  658    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  45.44 
 
 		 1028 aa  808    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  37.13 
 
 		 1055 aa  653    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  37.02 
 
 		 1051 aa  626  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  35.58 
 
 		 1052 aa  620  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  37.92 
 
 		 1065 aa  616  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  37.31 
 
 		 1042 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  37.27 
 
 		 1042 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  33.84 
 
 		 938 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  32.06 
 
 		 993 aa  360  7e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  32.02 
 
 		 905 aa  357  8.999999999999999e-97  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  34.3 
 
 		 956 aa  355  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  34.05 
 
 		 928 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  35.61 
 
 		 1053 aa  352  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  34.84 
 
 		 848 aa  332  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  37.58 
 
 		 1077 aa  320  9e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  33.44 
 
 		 813 aa  319  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  37.76 
 
 		 1287 aa  319  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  34.46 
 
 		 815 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  38.58 
 
 		 1348 aa  304  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 812 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  37.25 
 
 		 1418 aa  298  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  30.95 
 
 		 979 aa  297  8e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.27 
 
 		 974 aa  295  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  32.3 
 
 		 967 aa  287  8e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.95 
 
 		 979 aa  284  6.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  35.32 
 
 		 987 aa  280  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  24.74 
 
 		 952 aa  279  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  28.69 
 
 		 946 aa  276  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  30.26 
 
 		 1149 aa  272  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  25.76 
 
 		 953 aa  265  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  25.76 
 
 		 953 aa  265  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  30.65 
 
 		 949 aa  254  5.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  34.23 
 
 		 967 aa  253  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  30.18 
 
 		 949 aa  236  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  31.98 
 
 		 980 aa  231  7e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  33.94 
 
 		 773 aa  172  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  31.61 
 
 		 475 aa  151  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  30.31 
 
 		 459 aa  147  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  32.89 
 
 		 462 aa  147  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  26.83 
 
 		 536 aa  145  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  29.92 
 
 		 558 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  35.45 
 
 		 524 aa  143  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  33.24 
 
 		 556 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  31.44 
 
 		 606 aa  138  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  31.34 
 
 		 607 aa  138  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  31.03 
 
 		 469 aa  137  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  29.11 
 
 		 385 aa  129  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  29.2 
 
 		 643 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  28.9 
 
 		 629 aa  124  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  31.39 
 
 		 581 aa  124  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  30.17 
 
 		 560 aa  123  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  29.33 
 
 		 560 aa  118  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  29.03 
 
 		 398 aa  117  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  29.63 
 
 		 569 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  28.78 
 
 		 560 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  28.78 
 
 		 560 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  28.49 
 
 		 560 aa  115  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  29.81 
 
 		 550 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  27.93 
 
 		 787 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  29.23 
 
 		 545 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  29.23 
 
 		 545 aa  112  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  28.96 
 
 		 545 aa  110  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  28.1 
 
 		 538 aa  110  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  30.43 
 
 		 586 aa  109  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  26.12 
 
 		 706 aa  109  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  27.16 
 
 		 560 aa  108  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  26.76 
 
 		 899 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  28.65 
 
 		 586 aa  99.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  28.89 
 
 		 613 aa  100  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  27.39 
 
 		 590 aa  100  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  24.61 
 
 		 1115 aa  100  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.61 
 
 		 657 aa  99.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  27.32 
 
 		 586 aa  99.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  27.54 
 
 		 590 aa  99.8  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  27.16 
 
 		 760 aa  99  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  26.6 
 
 		 590 aa  98.6  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  27.1 
 
 		 590 aa  98.2  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  27.37 
 
 		 591 aa  98.6  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  26.98 
 
 		 760 aa  97.8  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  27.66 
 
 		 586 aa  97.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1062  type III restriction enzyme, res subunit  26.33 
 
 		 1138 aa  97.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  24.15 
 
 		 899 aa  97.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>