92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1689 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 402 aa  744    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  51.27 
 
 		 409 aa  338  8e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  48.37 
 
 		 396 aa  318  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 		 409 aa  309  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  46.27 
 
 		 420 aa  286  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 		 414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 		 402 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 448 aa  263  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  38.15 
 
 		 407 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  42.67 
 
 		 404 aa  252  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 		 417 aa  252  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  46.51 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  43.96 
 
 		 401 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  43.7 
 
 		 401 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 417 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 410 aa  240  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 430 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 		 414 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  40 
 
 		 402 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 390 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  42.09 
 
 		 409 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  43.67 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  42.93 
 
 		 403 aa  206  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 406 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 408 aa  189  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  32.39 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  29.84 
 
 		 464 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  38.56 
 
 		 405 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 		 412 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  40.99 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 417 aa  146  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  51.26 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 420 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 424 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  33.82 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  31.41 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  33.51 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 449 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  31.52 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  30.18 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 413 aa  103  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 405 aa  99.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 439 aa  99.8  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  34.04 
 
 		 407 aa  99.4  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 396 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  34.47 
 
 		 481 aa  93.6  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 404 aa  93.2  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  35.89 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 413 aa  89.7  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 425 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  30.99 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 1019 aa  73.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 469 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  34.83 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  28.19 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  27.45 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  28.61 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0224  hypothetical protein  33.04 
 
 		 177 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0168  membrane transport protein; multidrug resistance protein  32.14 
 
 		 177 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.450753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0200  hypothetical protein  32.14 
 
 		 177 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0179  hypothetical protein  33.04 
 
 		 177 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0181  hypothetical protein  33.04 
 
 		 177 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0200  hypothetical protein  32.14 
 
 		 177 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0171  membrane transport protein; multidrug resistance protein  32.14 
 
 		 177 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 433 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.96 
 
 		 590 aa  43.5  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0165  hypothetical protein  31.86 
 
 		 177 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>