123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0656 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  100 
 
 		 372 aa  775    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  37.53 
 
 		 368 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  37 
 
 		 394 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  36.27 
 
 		 380 aa  219  7e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  35.62 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  35.28 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  33.85 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  34.24 
 
 		 376 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  33.7 
 
 		 376 aa  189  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  33.59 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  33.42 
 
 		 376 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  33.42 
 
 		 376 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  33.24 
 
 		 356 aa  186  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  33.24 
 
 		 356 aa  186  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  33.42 
 
 		 376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  32.96 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  34.09 
 
 		 312 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  35.01 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  37.94 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  36.36 
 
 		 362 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  36.01 
 
 		 311 aa  166  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  31.56 
 
 		 359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  31.67 
 
 		 359 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  30.18 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  31.09 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  31.2 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  34.3 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  35.16 
 
 		 228 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  33.77 
 
 		 194 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2577  hypothetical protein  27.04 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1428  hypothetical protein  48.39 
 
 		 72 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  29.71 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  34.21 
 
 		 122 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  34.21 
 
 		 122 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.66 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.66 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1255  integrase  34.78 
 
 		 119 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.66 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.66 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.2 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.66 
 
 		 300 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  23.46 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.1 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  26.85 
 
 		 404 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00702  hypothetical protein  54.9 
 
 		 54 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000701341  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.28 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  22.41 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  23.1 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  23.1 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.1 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.1 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.1 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.1 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.1 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  23.03 
 
 		 359 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1711  phage integrase family site specific recombinase  22.78 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.109481  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  24.44 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  23.81 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  22.61 
 
 		 296 aa  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  23.19 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.97 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  26.11 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  25.78 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  21.62 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.26 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.43 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  28.03 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  22.18 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.13 
 
 		 303 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.13 
 
 		 303 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.13 
 
 		 303 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.39 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1561  site-specific recombinase phage integrase family protein  27.16 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.885578  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  23.57 
 
 		 420 aa  47  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 326 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.18 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  22.22 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  26.38 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.22 
 
 		 311 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.34 
 
 		 300 aa  46.6  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.94 
 
 		 300 aa  46.2  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  24.56 
 
 		 402 aa  46.2  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  23.98 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  26.25 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.68 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  25 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  21.51 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.75 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  21.88 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  26.43 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  24.31 
 
 		 307 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.19 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.07 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  27.11 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  21.4 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  22.92 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  22.42 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>