More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1711 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1711  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 412 aa  849    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.109481  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0824  site-specific recombinase, phage integrase family  33.66 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.966036  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1418  phage integrase family site specific recombinase  30.69 
 
 		 391 aa  159  7e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.239727  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1101  site-specific recombinase phage integrase family protein  31.55 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000786057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  28.21 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0063  DNA integration/recombination/inversion protein  28.61 
 
 		 396 aa  136  9e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  29.69 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  27.51 
 
 		 419 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1632  phage integrase  30.67 
 
 		 413 aa  132  9e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  hitchhiker  0.00880856 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  28.1 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0315  30S ribosomal protein S15  26.99 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00992142  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  27.56 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  26.73 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  27.15 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  30.38 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  28.87 
 
 		 411 aa  127  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  28.12 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3652  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  26.09 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  29.65 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0292  phage integrase family site specific recombinase  29.24 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  25.74 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  27.71 
 
 		 413 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  27.71 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  29.3 
 
 		 395 aa  123  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  29.08 
 
 		 419 aa  123  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  26.12 
 
 		 429 aa  122  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  26.76 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  28.26 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  27.63 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  28.78 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.84 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  29.24 
 
 		 418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  28.49 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  28.14 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  28.78 
 
 		 418 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  28.03 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  29.51 
 
 		 412 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  26.15 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3163  integrase family protein  28.71 
 
 		 429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0193699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  26 
 
 		 387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  27.7 
 
 		 412 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  26.88 
 
 		 402 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  26.59 
 
 		 404 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  26.39 
 
 		 410 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  30.94 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  26.93 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  28.01 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  24.93 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  26.07 
 
 		 404 aa  116  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  27.29 
 
 		 403 aa  116  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  26.15 
 
 		 404 aa  116  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  27.43 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  27.92 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  26.51 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  27.17 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  24.3 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  27.03 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  24.3 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  25.49 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  24.35 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  26.64 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  26.14 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  27.4 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.37 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  24.75 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  24.75 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  24.75 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  27.49 
 
 		 411 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0544  phage integrase family site specific recombinase  28.1 
 
 		 400 aa  113  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400058  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2014  phage integrase  27.5 
 
 		 416 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  29.9 
 
 		 402 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  25.91 
 
 		 412 aa  112  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 409 aa  112  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.81 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  28.37 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  27.32 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  25.88 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  27.63 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  26.24 
 
 		 402 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 411 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 411 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  27.04 
 
 		 404 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  27.4 
 
 		 413 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  24.36 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0886  phage integrase  28.74 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00972856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  27.55 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  26.51 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  27.44 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  23.87 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  26.45 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  25.18 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2957  integrase family protein  23.47 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  24.79 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  26.72 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  24.79 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  25.72 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  27.01 
 
 		 422 aa  106  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  27.1 
 
 		 428 aa  107  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>