More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0544 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0544  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 400 aa  813    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400058  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0292  phage integrase family site specific recombinase  84 
 
 		 400 aa  695    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  28.57 
 
 		 397 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0063  DNA integration/recombination/inversion protein  27.94 
 
 		 396 aa  149  7e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1101  site-specific recombinase phage integrase family protein  28.61 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000786057  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0824  site-specific recombinase, phage integrase family  30.62 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.966036  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1418  phage integrase family site specific recombinase  31.11 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.239727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  24.15 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  25.06 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  25.3 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  25.3 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  26.2 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  25.3 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  24.88 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  24.3 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  23.8 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  24.87 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  26.39 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  24.82 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  26.15 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  24.92 
 
 		 402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0315  30S ribosomal protein S15  28.77 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00992142  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  26.2 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0451  integrase family protein  26.18 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.53579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.2 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.2 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  28.21 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  25 
 
 		 445 aa  113  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  24.59 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  23.9 
 
 		 398 aa  113  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1711  phage integrase family site specific recombinase  28.1 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.109481  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  25.34 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  24.52 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  25.13 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  25.16 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3163  integrase family protein  27.56 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0193699 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  22.84 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  25.61 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.97 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  26.44 
 
 		 394 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  26.44 
 
 		 394 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  25.06 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  25.3 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  23.06 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  26.19 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  26.33 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  25 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  24.15 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  26.42 
 
 		 410 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  24.15 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  24.15 
 
 		 404 aa  106  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  22.71 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  23.26 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  23.98 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  24.16 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  22.99 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1632  phage integrase  23.51 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  hitchhiker  0.00880856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  22.7 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  24.87 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  25.19 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  25.06 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  23.23 
 
 		 413 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  25.36 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  23.49 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  23.26 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  23.87 
 
 		 425 aa  103  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  23.97 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  24.58 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  25.34 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  24.47 
 
 		 424 aa  103  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  23.68 
 
 		 419 aa  102  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  23.49 
 
 		 406 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  24.26 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  25.36 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  23.79 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  21.93 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1189  phage integrase family protein  23.83 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  23.32 
 
 		 409 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  23.8 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  29.58 
 
 		 412 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  23.97 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  22.33 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  25 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  24.24 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  22.96 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  25.19 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  25.19 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  23.49 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  23.99 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  23.13 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  23.27 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.35 
 
 		 422 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  24.74 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  24.88 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  25.19 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  23.8 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  23.3 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>