142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0184 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0184  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 185 aa  380  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  29.76 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  29.79 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  29.03 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  27.03 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  28.25 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  26.52 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  26.49 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  26.95 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  27.33 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1946  2',5' RNA ligase  28.75 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  31.65 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  30.12 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  29.84 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  28.74 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  28.74 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2732  hypothetical protein  25.79 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3219  hypothetical protein  25.79 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1770  hypothetical protein  25.79 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3686  2'-5' RNA ligase  25.79 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3743  2'-5' RNA ligase  25.79 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2784  2'-5' RNA ligase  25.79 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  29.2 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  29.45 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  30.66 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3712  2'-5' RNA ligase  25.79 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  28.49 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  25.79 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  27.72 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  30.22 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  29.12 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2412  hypothetical protein  25.93 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  31.07 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  28.68 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  28.49 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  29.45 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  27.63 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  29.3 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2786  2'-5' RNA ligase  27.98 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  31.86 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2364  hypothetical protein  26.04 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  23.37 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  29.44 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  31.11 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  27.86 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  27.74 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  26.81 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  24.85 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2556  hypothetical protein  23.13 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  27.23 
 
 		 178 aa  51.2  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  28.99 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  26.76 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  28.36 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  33.09 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  27.01 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1728  2'-5' RNA ligase  27.94 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.747406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  32.11 
 
 		 298 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  28.89 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3075  2'-5' RNA ligase  28.81 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  28.68 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  26.98 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  32.08 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  29.79 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0326  2'-5' RNA ligase  29.66 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3011  2'-5' RNA ligase  26.67 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  29.05 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  29.53 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  27.06 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  29.45 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  26.16 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  26.8 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  24.59 
 
 		 174 aa  48.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  31.03 
 
 		 177 aa  47.8  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  31.13 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  29.41 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  30.93 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  31.13 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  26.43 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  29.8 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  28.48 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  27.72 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  28.47 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5153  2'-5' RNA ligase  27.21 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198908  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  27.66 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2842  2',5' RNA ligase  27.07 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  25.42 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  27.87 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  25.18 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  30.07 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  28.3 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>