99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1536 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  100 
 
 		 276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  43.33 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  31.62 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  28.85 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  33.71 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  34.78 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  25.99 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  26.72 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  27.21 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  33.33 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  28.92 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.72 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  24.4 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3855  phospholipase/Carboxylesterase  31.44 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  25.42 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  26.26 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  28.87 
 
 		 422 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  26.92 
 
 		 357 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  25.69 
 
 		 795 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  28.63 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  30.37 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  31.51 
 
 		 227 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  27.78 
 
 		 414 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  28 
 
 		 370 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  23.08 
 
 		 340 aa  52.8  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  26.02 
 
 		 238 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.86 
 
 		 326 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  24.89 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  28.77 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  24.15 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  28.27 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  33.33 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  28.93 
 
 		 344 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  28.93 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  28.33 
 
 		 442 aa  49.3  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  25.91 
 
 		 361 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  22.42 
 
 		 486 aa  48.9  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  25.88 
 
 		 335 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  26.17 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  28.57 
 
 		 423 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  25.12 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.21 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  27.88 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  25.42 
 
 		 336 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  26.83 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.71 
 
 		 370 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  25.93 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  28.21 
 
 		 436 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  25.97 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  26.83 
 
 		 367 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  29.29 
 
 		 447 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  21.01 
 
 		 464 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  28.33 
 
 		 436 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.5 
 
 		 620 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0272535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  26.67 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  28.93 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2211  phospholipase/Carboxylesterase  26.9 
 
 		 210 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000781907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  27.6 
 
 		 563 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  24.09 
 
 		 405 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1149  Acylaminoacyl-peptidase  31.93 
 
 		 618 aa  46.2  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0889139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  25.32 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  27.38 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.05 
 
 		 374 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24510  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  31.01 
 
 		 712 aa  45.8  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0297  putative esterase  27.17 
 
 		 342 aa  45.8  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.203768  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.67 
 
 		 344 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.9 
 
 		 451 aa  45.8  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3306  phospholipase/carboxylesterase family protein  25 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703144  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  26.09 
 
 		 1002 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3289  PHB depolymerase family esterase  32.09 
 
 		 683 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  28.69 
 
 		 398 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0658  PHB depolymerase family esterase  32.09 
 
 		 683 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.726264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.75 
 
 		 678 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  27.86 
 
 		 447 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  26.45 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  28.57 
 
 		 432 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.19 
 
 		 462 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  25.35 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2499  phospholipase/Carboxylesterase  29.13 
 
 		 214 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.982674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4277  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  21.57 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0732  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.78 
 
 		 626 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.517111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.01 
 
 		 596 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  30.29 
 
 		 850 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  27.39 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0092  phospholipase/Carboxylesterase  20.77 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.898581  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0811  phospholipase/Carboxylesterase  24.58 
 
 		 220 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.120747  normal  0.850191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.57 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  25.56 
 
 		 312 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3140  phospholipase/carboxylesterase  26.49 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0649605  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  28.91 
 
 		 352 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34870  predicted esterase  26.14 
 
 		 214 aa  42.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.786447  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0940  phospholipase/Carboxylesterase  26.04 
 
 		 222 aa  42.7  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  24.1 
 
 		 405 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_002978  WD1006  phospholipase/carboxylesterase family protein  23.87 
 
 		 214 aa  42.4  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  23.81 
 
 		 223 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0181  phospholipase/carboxylesterase  25.64 
 
 		 213 aa  42.4  0.009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>