110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1228 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1228  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 175 aa  342  1e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.205695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  21.77 
 
 		 862 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  23.62 
 
 		 356 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  21.77 
 
 		 825 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  21.77 
 
 		 825 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  21.77 
 
 		 825 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  21.77 
 
 		 825 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  21.77 
 
 		 825 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  21.77 
 
 		 825 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3671  pentapeptide repeat-containing protein  32.18 
 
 		 153 aa  51.2  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.388606  hitchhiker  0.00562165 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 355 aa  51.2  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  21.38 
 
 		 381 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  19.83 
 
 		 416 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  24.49 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  21.33 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  20.99 
 
 		 734 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  20.28 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  27.01 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  24.73 
 
 		 363 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0869  pentapeptide repeat protein  30.36 
 
 		 290 aa  48.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  22.06 
 
 		 309 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  20.77 
 
 		 206 aa  47.8  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1048 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2569  pentapeptide repeat protein  29.2 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  23.36 
 
 		 343 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1048 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  23.36 
 
 		 343 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  19.08 
 
 		 309 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  25.53 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  23.31 
 
 		 370 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 452 aa  45.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  26.45 
 
 		 408 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 844 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  28.24 
 
 		 187 aa  44.7  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  20.81 
 
 		 866 aa  44.7  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  19.87 
 
 		 219 aa  44.3  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  21.78 
 
 		 600 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.05 
 
 		 949 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  24.5 
 
 		 657 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  21.48 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  22 
 
 		 366 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  25.21 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  21.48 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  27.14 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2505  pentapeptide repeat protein  19.85 
 
 		 371 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  27.05 
 
 		 349 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2446  acetyltransferase  28.48 
 
 		 308 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.034806  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  22.69 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  18.31 
 
 		 381 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  22.29 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  21.19 
 
 		 412 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  25.17 
 
 		 452 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  29.29 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  21.21 
 
 		 412 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  25 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2954  acetyltransferase, GNAT family  27.35 
 
 		 312 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878787  hitchhiker  0.00000560426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  24.17 
 
 		 268 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  25.71 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  26.23 
 
 		 448 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.94 
 
 		 14916 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08061  hypothetical protein  36.26 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  20.28 
 
 		 360 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  18.62 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  21.74 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6425  pentapeptide repeat-containing protein  22.5 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.878148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  24.83 
 
 		 242 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5846  hypothetical protein  25 
 
 		 727 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.909355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  22.67 
 
 		 846 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  25.93 
 
 		 237 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  20.28 
 
 		 360 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  20.28 
 
 		 360 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  20.28 
 
 		 360 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  20.28 
 
 		 360 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  20.28 
 
 		 360 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2377  acetyltransferase, GNAT family  27.35 
 
 		 308 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  21.02 
 
 		 343 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  35.63 
 
 		 607 aa  41.6  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  27.59 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  27.03 
 
 		 359 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 		 220 aa  42  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2247  acetyltransferase  27.21 
 
 		 308 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0012519  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  21.31 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2411  acetyltransferase  27.21 
 
 		 308 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  24.53 
 
 		 196 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  20.93 
 
 		 493 aa  41.6  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  17.72 
 
 		 389 aa  41.6  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3601  pentapeptide repeat protein  18.75 
 
 		 371 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  28.76 
 
 		 327 aa  41.6  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  22.97 
 
 		 182 aa  41.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  21.43 
 
 		 489 aa  41.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1840  hypothetical protein  26.14 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  24.86 
 
 		 242 aa  41.2  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  18.3 
 
 		 259 aa  41.2  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2510  acetyltransferase, GNAT family  27.21 
 
 		 308 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  22.83 
 
 		 332 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  21.02 
 
 		 870 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  20 
 
 		 286 aa  41.2  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>