293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3671 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3671  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.388606  hitchhiker  0.00562165 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  35.09 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  35.09 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  40.22 
 
 		 456 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  35.09 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 		 315 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  29.93 
 
 		 181 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  29.23 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  31.68 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  36.96 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  32.38 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  31.78 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  42.35 
 
 		 349 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.58 
 
 		 14916 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  33.7 
 
 		 657 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 367 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  30.7 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 367 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  31.82 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  31.18 
 
 		 336 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  31.18 
 
 		 336 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1228  pentapeptide repeat-containing protein  32.18 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.205695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  34.44 
 
 		 229 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 222 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  31.87 
 
 		 211 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  32.41 
 
 		 830 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  32.18 
 
 		 211 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  31.87 
 
 		 211 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  35.96 
 
 		 254 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  32.41 
 
 		 830 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  33.03 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  33.03 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  33.04 
 
 		 485 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  28.68 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  33.01 
 
 		 189 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  33.6 
 
 		 493 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  37.97 
 
 		 366 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  37.97 
 
 		 366 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  36.26 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  29.21 
 
 		 294 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  33.65 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1294  serine/threonine protein kinase  40.51 
 
 		 522 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  37.97 
 
 		 366 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 		 333 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11313  predicted protein  35.44 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.129582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5846  hypothetical protein  33.7 
 
 		 727 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.909355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3657  pentapeptide repeat-containing protein  35.63 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  32.11 
 
 		 1807 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  32.2 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  31.87 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  33.7 
 
 		 412 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  32.71 
 
 		 734 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 		 567 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  39.73 
 
 		 1831 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  37.97 
 
 		 366 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  34.67 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  31.87 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.77 
 
 		 381 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  26.88 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 365 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1548  pentapeptide repeat protein  34.65 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  34.38 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  35.56 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  34.95 
 
 		 222 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2588  pentapeptide repeat-containing protein  39.73 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  31.87 
 
 		 211 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  32.29 
 
 		 976 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  31.53 
 
 		 452 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  35.37 
 
 		 214 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  38.14 
 
 		 576 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  35.85 
 
 		 241 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  37.8 
 
 		 866 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  35.9 
 
 		 199 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1609  pentapeptide repeat protein  39.74 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  33.71 
 
 		 309 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  39.02 
 
 		 203 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 267 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  33.64 
 
 		 237 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  30.61 
 
 		 222 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  35.06 
 
 		 514 aa  47.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07611  pentapeptide repeat-containing protein  33.71 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  hitchhiker  0.00156438 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 266 aa  47.4  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  30.86 
 
 		 497 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  31.33 
 
 		 961 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0386  pentapeptide repeat protein  39.66 
 
 		 509 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4190  pentapeptide repeat protein  35.23 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  27.48 
 
 		 440 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  28.93 
 
 		 319 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  29.27 
 
 		 447 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  31.78 
 
 		 245 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  26.98 
 
 		 401 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  37.23 
 
 		 450 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  26.98 
 
 		 401 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 		 229 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  34.67 
 
 		 1033 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08061  hypothetical protein  30.77 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>