More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0522 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 787 aa  1617    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.79 
 
 		 544 aa  180  1e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.47 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.63 
 
 		 518 aa  174  6.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  30.68 
 
 		 542 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.2 
 
 		 582 aa  169  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.39 
 
 		 553 aa  168  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  37.59 
 
 		 553 aa  168  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.25 
 
 		 532 aa  167  5e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.86 
 
 		 554 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.86 
 
 		 554 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.78 
 
 		 532 aa  165  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.58 
 
 		 517 aa  165  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  33.91 
 
 		 557 aa  161  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  27.85 
 
 		 545 aa  160  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  33.08 
 
 		 552 aa  159  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.97 
 
 		 575 aa  157  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  37.3 
 
 		 609 aa  157  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  35.68 
 
 		 536 aa  157  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  35.8 
 
 		 539 aa  157  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  37.21 
 
 		 556 aa  156  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  37.21 
 
 		 556 aa  156  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.45 
 
 		 555 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  26.42 
 
 		 559 aa  155  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.75 
 
 		 541 aa  155  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.71 
 
 		 595 aa  155  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  30.84 
 
 		 559 aa  155  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.69 
 
 		 541 aa  154  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.26 
 
 		 555 aa  154  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  32.32 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.92 
 
 		 546 aa  154  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.92 
 
 		 546 aa  154  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.92 
 
 		 546 aa  154  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.65 
 
 		 548 aa  154  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  27.52 
 
 		 548 aa  154  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  30.8 
 
 		 547 aa  154  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  27.52 
 
 		 548 aa  154  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.65 
 
 		 548 aa  153  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.65 
 
 		 548 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.12 
 
 		 548 aa  153  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.12 
 
 		 548 aa  153  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.12 
 
 		 548 aa  153  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.12 
 
 		 548 aa  153  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.65 
 
 		 548 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.51 
 
 		 541 aa  153  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.12 
 
 		 548 aa  153  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.65 
 
 		 548 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.12 
 
 		 548 aa  153  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  31.13 
 
 		 583 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.84 
 
 		 545 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  39.04 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  27.89 
 
 		 548 aa  152  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  31.49 
 
 		 584 aa  152  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  34.4 
 
 		 548 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.61 
 
 		 530 aa  151  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.58 
 
 		 557 aa  151  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.43 
 
 		 543 aa  150  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  39.56 
 
 		 225 aa  150  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  29.46 
 
 		 569 aa  150  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.84 
 
 		 543 aa  150  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  37.7 
 
 		 528 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.2 
 
 		 530 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.84 
 
 		 544 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.84 
 
 		 543 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.2 
 
 		 528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  34.12 
 
 		 566 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.75 
 
 		 567 aa  148  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  35.64 
 
 		 537 aa  148  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  37.5 
 
 		 542 aa  148  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.43 
 
 		 548 aa  148  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 		 533 aa  148  4.0000000000000006e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  35.81 
 
 		 584 aa  148  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6897  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.78 
 
 		 672 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  32.49 
 
 		 557 aa  148  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.96 
 
 		 578 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  29.06 
 
 		 531 aa  147  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1109  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  27.03 
 
 		 626 aa  147  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.96 
 
 		 578 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  33.09 
 
 		 570 aa  146  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.91 
 
 		 550 aa  147  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  38.12 
 
 		 536 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  27.6 
 
 		 607 aa  147  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  37.28 
 
 		 531 aa  146  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.08 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.08 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.25 
 
 		 610 aa  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.25 
 
 		 610 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.7 
 
 		 550 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  38.1 
 
 		 616 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  29.89 
 
 		 583 aa  146  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.84 
 
 		 607 aa  146  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.08 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.08 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.33 
 
 		 581 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  35.69 
 
 		 616 aa  145  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4506  60 kDa inner membrane insertion protein  28.63 
 
 		 549 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.417541  normal  0.699877 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  35 
 
 		 699 aa  145  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.57 
 
 		 632 aa  145  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.11 
 
 		 540 aa  145  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  32.59 
 
 		 541 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>