125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2280 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2280  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 310 aa  595  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0666  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.107374  normal  0.0631773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2395  tetratricopeptide TPR_2  41.63 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2811  tetratricopeptide repeat-containing protein  37.41 
 
 		 285 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0556541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4498  Tetratricopeptide domain protein  37.31 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1164  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.660548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1134  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0878  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.06 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.213788  hitchhiker  0.0000283657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.12 
 
 		 1154 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.65 
 
 		 810 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 827 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07001  hypothetical protein  32.67 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.57 
 
 		 725 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.64 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3395  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.34 
 
 		 652 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105857  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.41 
 
 		 632 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2166  hypothetical protein  37.1 
 
 		 131 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4573  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.64 
 
 		 3590 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.89 
 
 		 1402 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.06 
 
 		 344 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 878 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 344 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0675  Tetratricopeptide domain protein  26.42 
 
 		 464 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.682908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 3301 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 3172 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  20.9 
 
 		 597 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  25.56 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.48 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0887  Tetratricopeptide domain protein  28.65 
 
 		 1339 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.102317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  29.09 
 
 		 321 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  23.41 
 
 		 622 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.37 
 
 		 1486 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0158  tetratricopeptide repeat protein  25 
 
 		 400 aa  50.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.185124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.53 
 
 		 689 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.39 
 
 		 764 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 737 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 318 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 795 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13974  predicted protein  25.98 
 
 		 353 aa  49.3  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 718 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.25 
 
 		 938 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000435275  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.16 
 
 		 832 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24 
 
 		 887 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  20.93 
 
 		 1069 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1388  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739804  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  26.36 
 
 		 475 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 		 565 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 1979 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0074  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.67 
 
 		 967 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  22.57 
 
 		 1073 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  25.27 
 
 		 1415 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  27.01 
 
 		 864 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  26 
 
 		 545 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 3145 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 		 1737 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  25.65 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.71 
 
 		 733 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.91 
 
 		 626 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26 
 
 		 587 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.91 
 
 		 626 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 313 aa  45.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 614 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 404 aa  45.8  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.59 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.91 
 
 		 614 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.91 
 
 		 614 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 614 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1138 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 586 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.44 
 
 		 626 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  26.37 
 
 		 936 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  23.53 
 
 		 661 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.2 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  32.82 
 
 		 1160 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 421 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 968 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 884 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.09 
 
 		 1100 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 1838 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0350  hypothetical protein  39.29 
 
 		 132 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0301232  normal  0.125354 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 1827 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  31.65 
 
 		 933 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 800 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 767 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  24.31 
 
 		 632 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 448 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.2 
 
 		 2240 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 761 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 		 393 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 465 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 534 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  22.4 
 
 		 398 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  28.48 
 
 		 606 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>