More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2131 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  100 
 
 		 690 aa  1348    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  36.99 
 
 		 720 aa  378  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  37.29 
 
 		 730 aa  359  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  37.36 
 
 		 730 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  35.87 
 
 		 731 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  35.34 
 
 		 729 aa  341  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  34.9 
 
 		 724 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  37.61 
 
 		 735 aa  324  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  30 
 
 		 677 aa  185  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  31.86 
 
 		 681 aa  177  8e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  28.35 
 
 		 700 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  30.73 
 
 		 715 aa  143  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  31.34 
 
 		 698 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  27.66 
 
 		 709 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  30.4 
 
 		 777 aa  137  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  26.78 
 
 		 709 aa  133  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  32.99 
 
 		 719 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  29.26 
 
 		 747 aa  125  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  33.66 
 
 		 628 aa  125  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 652 aa  125  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  30.17 
 
 		 721 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  42.08 
 
 		 659 aa  122  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  36.15 
 
 		 643 aa  122  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  43.98 
 
 		 693 aa  121  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  47.3 
 
 		 678 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  30.69 
 
 		 782 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  44.79 
 
 		 657 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  44 
 
 		 707 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  46.62 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  44.79 
 
 		 657 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  43.53 
 
 		 660 aa  118  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  42.68 
 
 		 642 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 798 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  28.75 
 
 		 637 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  42.51 
 
 		 671 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  41.22 
 
 		 663 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 643 aa  115  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  37.33 
 
 		 748 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  40.4 
 
 		 179 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 193 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  42 
 
 		 660 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  27.98 
 
 		 649 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  33 
 
 		 655 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 679 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  27.98 
 
 		 649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  43.06 
 
 		 654 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  41.92 
 
 		 653 aa  112  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  42.46 
 
 		 690 aa  111  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  32.3 
 
 		 661 aa  112  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  42.57 
 
 		 603 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  31.73 
 
 		 760 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  32.32 
 
 		 655 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  42.76 
 
 		 663 aa  111  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  31.65 
 
 		 788 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  31.12 
 
 		 686 aa  111  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  48.84 
 
 		 672 aa  111  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  42.11 
 
 		 669 aa  111  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  28.9 
 
 		 645 aa  110  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.49 
 
 		 638 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  33.22 
 
 		 657 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  42.38 
 
 		 642 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  32.79 
 
 		 757 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  40.41 
 
 		 648 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  30.38 
 
 		 833 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 190 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  35.95 
 
 		 201 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  37.82 
 
 		 739 aa  108  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  48.48 
 
 		 682 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  45.14 
 
 		 647 aa  108  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  42.76 
 
 		 774 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  38.8 
 
 		 650 aa  108  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  37.67 
 
 		 195 aa  108  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  42.35 
 
 		 676 aa  108  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  38.8 
 
 		 650 aa  108  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  40.68 
 
 		 653 aa  108  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  48.92 
 
 		 590 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  42.76 
 
 		 774 aa  108  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 655 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  40.41 
 
 		 195 aa  108  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  41.18 
 
 		 651 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  41.18 
 
 		 651 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  41.18 
 
 		 651 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  30.6 
 
 		 716 aa  107  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  41.18 
 
 		 651 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  38.8 
 
 		 650 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  31.21 
 
 		 650 aa  107  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  41.18 
 
 		 651 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  41.18 
 
 		 651 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  38.8 
 
 		 650 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  41.18 
 
 		 651 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  38.8 
 
 		 650 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  38.8 
 
 		 607 aa  107  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  40.52 
 
 		 664 aa  107  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  41.45 
 
 		 776 aa  107  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  41.06 
 
 		 650 aa  107  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  40.94 
 
 		 199 aa  107  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  41.06 
 
 		 642 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  41.18 
 
 		 651 aa  107  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  40.43 
 
 		 717 aa  106  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  37.18 
 
 		 735 aa  106  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>