More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1193 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  316  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  95.54 
 
 		 157 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  84.71 
 
 		 160 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  83.44 
 
 		 161 aa  268  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  83.44 
 
 		 165 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  83.44 
 
 		 165 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  82.8 
 
 		 158 aa  267  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  81.53 
 
 		 158 aa  266  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  82.17 
 
 		 158 aa  265  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  82.17 
 
 		 158 aa  265  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  82.17 
 
 		 158 aa  265  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  82.8 
 
 		 158 aa  266  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  82.8 
 
 		 158 aa  263  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  78.98 
 
 		 160 aa  256  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  76.58 
 
 		 161 aa  243  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  76.13 
 
 		 158 aa  241  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  57.79 
 
 		 181 aa  190  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  56.49 
 
 		 158 aa  187  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 174 aa  183  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  55.19 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  53.9 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 159 aa  173  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 173 aa  146  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  47.59 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 167 aa  144  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  49.65 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 167 aa  132  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  43.57 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  40 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 182 aa  114  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  40.28 
 
 		 187 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  38.85 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 177 aa  88.6  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  27.7 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  34.11 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  31.25 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  35.29 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  28.77 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  25.58 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  26.32 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  36.05 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  32.5 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.68 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.68 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  32.65 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  34.31 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>