More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4557 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4557  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 274 aa  545  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.194506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5383  AraC family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 237 aa  205  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3314  AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2404  AraC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 290 aa  185  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2370  AraC family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 284 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4276  AraC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2744  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2700  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2730  AraC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3835  transcriptional regulator, AraC family  37.4 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  37.55 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1081  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 255 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3550  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 258 aa  112  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04860  hypothetical protein  33.77 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  35.71 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  34.33 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  33.62 
 
 		 259 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1856  transcriptional regulator, AraC family  27.83 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0387007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2766  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 282 aa  99.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 283 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  33.19 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  31.76 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 259 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 256 aa  95.9  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  33.18 
 
 		 295 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  33.47 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  30.97 
 
 		 278 aa  95.5  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1171  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 258 aa  93.6  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  31.14 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2338  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317534  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 261 aa  92.8  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  28.33 
 
 		 305 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 276 aa  92  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  30.43 
 
 		 267 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 272 aa  92  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 259 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0616  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1352  helix-turn-helix domain-containing protein  27.39 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.436375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>