More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0326 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0326  transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  637    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.237468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6821  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  31.23 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  27.16 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  26.99 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  28.13 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 299 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  26.3 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  26.51 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  23.55 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  26.46 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.25 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  25.68 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  25.76 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  26.28 
 
 		 346 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 		 360 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5650  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  25.58 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  23.62 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 335 aa  99.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 329 aa  99  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1180  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.688099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 341 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  25.09 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.19 
 
 		 324 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.75 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  22.83 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  22.39 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 332 aa  93.2  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  23.89 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0916  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 335 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  22.81 
 
 		 321 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  24.48 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  25.11 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  25.38 
 
 		 361 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 342 aa  90.1  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 337 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.34 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 322 aa  86.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  23.76 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.37 
 
 		 293 aa  86.7  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  25.61 
 
 		 347 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 347 aa  86.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  27.02 
 
 		 345 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  25.61 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5594  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  25.26 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.67 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6286  transcriptional regulator, AraC family  29.32 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  28.98 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0309  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  26.85 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  26.25 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0966  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 335 aa  79  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.46 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2824  transcriptional regulator, AraC family  31.84 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.60964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2418  transcriptional regulator, AraC family  32.4 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0385  transcriptional regulator  23.56 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>