More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2822 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2822  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1027 aa  2090    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000227615  normal  0.366957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01075  AcrB/AcrD/AcrF family protein  52.42 
 
 		 1026 aa  1049    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1923  AcrB/AcrD/AcrF family protein  76.41 
 
 		 1020 aa  1640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2277  acriflavin resistance protein  77.1 
 
 		 1015 aa  1651    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2516  acriflavin resistance protein  78.17 
 
 		 1015 aa  1620    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560727  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1828  acriflavin resistance protein  88.68 
 
 		 1025 aa  1866    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0227595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2636  acriflavin resistance protein  78.07 
 
 		 1015 aa  1620    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1828  acriflavin resistance protein  78.17 
 
 		 1015 aa  1620    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.575203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2194  acriflavin resistance protein  75.56 
 
 		 1030 aa  1622    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2231  acriflavin resistance protein  51.58 
 
 		 1040 aa  1006    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  40 
 
 		 1026 aa  715    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643434 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1627  acriflavin resistance protein  78.07 
 
 		 1018 aa  1648    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1702  acriflavin resistance protein  77.88 
 
 		 1018 aa  1644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2383  acriflavin resistance protein  74.61 
 
 		 1021 aa  1612    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1702  acriflavin resistance protein  77.58 
 
 		 1018 aa  1616    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1779  acriflavin resistance protein  87.61 
 
 		 1025 aa  1853    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  72.68 
 
 		 1019 aa  1552    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2523  acriflavin resistance protein  78.17 
 
 		 1015 aa  1620    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1647  acriflavin resistance protein  80.82 
 
 		 1015 aa  1726    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00322  RND superfamily protein  38.5 
 
 		 823 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1011 aa  429  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2528  acriflavin resistance protein  29.68 
 
 		 1053 aa  415  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.263443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1046 aa  410  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  29.93 
 
 		 1024 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1050 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 		 1044 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 		 1034 aa  389  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.05 
 
 		 1034 aa  385  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 		 1040 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1043 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  28.44 
 
 		 1044 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 		 1032 aa  366  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  27.16 
 
 		 1009 aa  363  1e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.04 
 
 		 1071 aa  362  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  25.5 
 
 		 1038 aa  361  3e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.09 
 
 		 1024 aa  361  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1014 aa  357  5.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 1496 aa  356  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1017 aa  355  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1043 aa  353  5.9999999999999994e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.76 
 
 		 1470 aa  351  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  27.7 
 
 		 1006 aa  351  4e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1038 aa  350  7e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  24.42 
 
 		 1058 aa  350  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1023 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 		 1173 aa  348  4e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 		 1028 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  25.75 
 
 		 1059 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1036 aa  344  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1041 aa  343  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.67 
 
 		 1036 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  24.74 
 
 		 1063 aa  340  5e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  24.74 
 
 		 1039 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  28.49 
 
 		 1064 aa  340  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  28.58 
 
 		 1027 aa  340  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  26.88 
 
 		 1022 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1034 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.7 
 
 		 1039 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  27.52 
 
 		 1038 aa  338  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 		 1045 aa  338  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1050 aa  337  5.999999999999999e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  24.67 
 
 		 1053 aa  337  7.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  26.32 
 
 		 1027 aa  336  1e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1058 aa  336  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1028 aa  335  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 		 1028 aa  334  5e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1065 aa  334  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  26.49 
 
 		 1040 aa  334  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  25.81 
 
 		 1050 aa  334  6e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  24.9 
 
 		 1058 aa  332  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1044 aa  331  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 		 1048 aa  330  9e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1041 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1075 aa  329  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1067 aa  328  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1015 aa  326  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 		 1049 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 		 1026 aa  326  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.86 
 
 		 1055 aa  325  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  26 
 
 		 1030 aa  325  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1047 aa  324  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 		 1041 aa  324  7e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 		 1041 aa  323  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  26.64 
 
 		 1026 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.52 
 
 		 1069 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1074 aa  318  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1072 aa  317  6e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1055 aa  316  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1030 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1033 aa  316  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  26.02 
 
 		 1040 aa  315  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  26.49 
 
 		 1043 aa  313  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1065 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 		 1044 aa  310  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  26.32 
 
 		 1054 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1101 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 		 1054 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  25.28 
 
 		 1016 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  25.17 
 
 		 1014 aa  307  6e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  26.26 
 
 		 1013 aa  307  7e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>