267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1965 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  58.05 
 
 		 732 aa  789    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  59.88 
 
 		 680 aa  761    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  67.97 
 
 		 667 aa  927    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  54.01 
 
 		 734 aa  744    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  55.7 
 
 		 709 aa  751    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  56.29 
 
 		 707 aa  754    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 674 aa  1390    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  48.54 
 
 		 730 aa  674    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  53.76 
 
 		 739 aa  738    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  53.76 
 
 		 739 aa  738    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  57.75 
 
 		 689 aa  822    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  57.73 
 
 		 715 aa  782    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  57.73 
 
 		 715 aa  780    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  57.03 
 
 		 691 aa  777    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  53.87 
 
 		 734 aa  740    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  57.58 
 
 		 715 aa  783    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  53.04 
 
 		 689 aa  680    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  33.47 
 
 		 754 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  34.22 
 
 		 641 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  34.92 
 
 		 660 aa  365  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  34.85 
 
 		 669 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  35.11 
 
 		 668 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  35.66 
 
 		 662 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  34.37 
 
 		 661 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  34.91 
 
 		 662 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  35.62 
 
 		 667 aa  347  6e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  32.52 
 
 		 653 aa  342  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  33.69 
 
 		 683 aa  333  5e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  32.5 
 
 		 656 aa  322  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  32.01 
 
 		 696 aa  321  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  32.56 
 
 		 681 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  31.78 
 
 		 705 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  33.66 
 
 		 767 aa  307  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  32.8 
 
 		 767 aa  295  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  32.24 
 
 		 671 aa  295  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  33.23 
 
 		 676 aa  293  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  29.26 
 
 		 645 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  33.62 
 
 		 687 aa  277  6e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  30.2 
 
 		 645 aa  269  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  36.97 
 
 		 674 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  36.97 
 
 		 674 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  31.03 
 
 		 698 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  31.96 
 
 		 688 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  30.01 
 
 		 673 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  31.79 
 
 		 688 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  29.62 
 
 		 680 aa  243  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  29.82 
 
 		 689 aa  243  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  31.81 
 
 		 672 aa  242  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  33.57 
 
 		 676 aa  241  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  31.53 
 
 		 673 aa  241  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  30.05 
 
 		 684 aa  233  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  29.34 
 
 		 662 aa  229  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  35.44 
 
 		 943 aa  227  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  29.25 
 
 		 635 aa  224  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  29.01 
 
 		 662 aa  220  5e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  31.77 
 
 		 649 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  30.82 
 
 		 685 aa  213  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  28.35 
 
 		 685 aa  213  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  28.35 
 
 		 685 aa  212  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  31.72 
 
 		 668 aa  209  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  31.49 
 
 		 706 aa  200  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  30.67 
 
 		 726 aa  195  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  27.52 
 
 		 634 aa  180  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  25.56 
 
 		 633 aa  170  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  27.29 
 
 		 639 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  29.22 
 
 		 644 aa  154  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  25.52 
 
 		 644 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  24.4 
 
 		 692 aa  150  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  25.49 
 
 		 632 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  25.54 
 
 		 631 aa  140  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  27.77 
 
 		 632 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  22.57 
 
 		 637 aa  124  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  24.91 
 
 		 634 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  24.4 
 
 		 744 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  25 
 
 		 730 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  39.44 
 
 		 760 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  31.84 
 
 		 737 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 		 800 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  24.36 
 
 		 681 aa  100  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  25.66 
 
 		 815 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  22.47 
 
 		 790 aa  97.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  37.69 
 
 		 782 aa  96.3  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  27.9 
 
 		 806 aa  94  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  26.49 
 
 		 826 aa  92  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  21.47 
 
 		 728 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  24.7 
 
 		 862 aa  91.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  37.4 
 
 		 890 aa  90.5  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  42.16 
 
 		 788 aa  87.4  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  32 
 
 		 850 aa  87.4  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  29.82 
 
 		 1238 aa  86.7  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  24.23 
 
 		 742 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  24.18 
 
 		 795 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  33.8 
 
 		 730 aa  85.1  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  22.45 
 
 		 742 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  36.69 
 
 		 763 aa  83.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  39.62 
 
 		 673 aa  82.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  24.17 
 
 		 635 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  26.32 
 
 		 763 aa  82  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  26.95 
 
 		 736 aa  81.6  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  33.57 
 
 		 720 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>