More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7350 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2545  tetratricopeptide domain-containing protein  60 
 
 
672 aa  663    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7350  hypothetical protein  100 
 
 
668 aa  1289    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  52.7 
 
 
612 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  43.58 
 
 
707 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3430  hypothetical protein  44.01 
 
 
695 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112777  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2764  TPR repeat-containing protein  41.55 
 
 
683 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0731  hypothetical protein  39.23 
 
 
567 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
628 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
361 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2266  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 
622 aa  127  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.78 
 
 
462 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  34.07 
 
 
706 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
617 aa  120  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.05 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  30.47 
 
 
706 aa  116  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 
3035 aa  114  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
3560 aa  114  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.63 
 
 
1056 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.97 
 
 
988 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 
306 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.52 
 
 
1022 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
371 aa  110  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.96 
 
 
818 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
927 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 
649 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
1276 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.96 
 
 
784 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
352 aa  108  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 
878 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.81 
 
 
1694 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
391 aa  107  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 
515 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
1421 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
543 aa  105  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
284 aa  104  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  32.76 
 
 
582 aa  104  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  27.76 
 
 
334 aa  104  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.84 
 
 
810 aa  104  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.58 
 
 
357 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
547 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  30.58 
 
 
306 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
605 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  28.93 
 
 
442 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 
465 aa  101  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.04 
 
 
406 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.04 
 
 
406 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
4079 aa  100  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 
392 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.19 
 
 
308 aa  100  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.4 
 
 
1056 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
280 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25 
 
 
1007 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
1192 aa  99.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
685 aa  99  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  35.12 
 
 
342 aa  99  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.29 
 
 
576 aa  98.6  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.88 
 
 
1979 aa  98.2  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 
681 aa  98.2  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
750 aa  97.8  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  29.45 
 
 
581 aa  97.4  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.41 
 
 
875 aa  97.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 
632 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
425 aa  95.5  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 
331 aa  95.5  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 
279 aa  95.5  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.88 
 
 
352 aa  95.1  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
543 aa  94.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.94 
 
 
314 aa  94.4  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  28.52 
 
 
539 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 
608 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 
711 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
637 aa  92.8  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.54 
 
 
397 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 
4489 aa  92.8  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.1 
 
 
343 aa  92.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  36.4 
 
 
593 aa  92  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 
301 aa  91.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
3145 aa  91.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 
732 aa  91.3  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 
308 aa  91.3  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 
935 aa  90.9  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.26 
 
 
730 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.36 
 
 
778 aa  89.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 
955 aa  89.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 
909 aa  89.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  31.8 
 
 
725 aa  89.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 
1276 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.69 
 
 
367 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  27.47 
 
 
295 aa  89  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
301 aa  88.2  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
297 aa  88.2  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 
292 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  23.5 
 
 
820 aa  87.8  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 
404 aa  87.4  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 
602 aa  87  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  25.37 
 
 
573 aa  87  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.96 
 
 
738 aa  87  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.88 
 
 
629 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
362 aa  86.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
1827 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>